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特定功能微生物菌株篩選與培養(yǎng),首發(fā)于微基生物。

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高效篩選、定向培養(yǎng)、功能菌株篩選、全流程服務(wù)

 

   在環(huán)境、能源、醫(yī)藥等眾多領(lǐng)域,通過篩選與培養(yǎng)具有特定功能的微生物菌株,可以為解決實際問題提供有效的微生物解決方案。

微基生物依托高通量培養(yǎng)組學技術(shù),結(jié)合多種培養(yǎng)條件和培養(yǎng)基,從復雜樣本中分離和篩選出具有降解污染物、固氮、解磷、產(chǎn)生物活性物質(zhì)等特定功能的微生物菌株,顯著提篩選效率和成功率。

服務(wù)亮點

高效篩選:采用高通量培養(yǎng)組學技術(shù),快速鎖定目標菌株,大幅縮短篩選周期。

定向培養(yǎng):定制化培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件,滿足目標菌株的生長需求,確保高成功率。

功能菌株篩選專注于篩選具有特定功能的微生物菌株,滿足客戶多樣化需求。

全流程服務(wù):從樣本檢測到菌株純化、鑒定及功能驗證,一站式解決客戶問題。

服務(wù)流程

1.樣本檢測

對原始樣本進行二代高通量測序,檢測樣本中微生物的種類及其相對豐度。

2.培養(yǎng)條件確定

根據(jù)客戶需求和測序結(jié)果,確定目標菌株的培養(yǎng)條件和培養(yǎng)基。

3.微生物培養(yǎng)與純化

利用選定的培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件進行培養(yǎng),利用96孔板進行大規(guī)模的分離和純化。

4.菌種鑒定

對最終純化好的菌株進行基因水平的菌種鑒定,確認菌株的分類學屬性。

5.功能驗證

對篩選出的目標菌株進行功能驗證,確保其具備所需的特定功能。

樣本類型

土壤、水體、動植物組織、極端環(huán)境樣本(熱泉、凍土、鹽湖)、工業(yè)發(fā)酵液等復雜基質(zhì)

樣本保存和寄送

樣本采集后立即放入微生物活菌保存液中,盡快置于-80℃凍存。

所有樣本采集完成后,使用冰盒中郵寄至檢測公司。

案例分享

從印度鹽田中分離嗜鹽菌并篩選其水解酶生產(chǎn)能力Isolation and characterization of halophilic isolates from Indian salterns and their screening for production of hydrolytic enzymes.2022)

嗜鹽菌是一類能夠在高鹽環(huán)境中生存的微生物,其產(chǎn)生的水解酶在極端條件下(如高鹽、高溫、極端pH等)具有穩(wěn)定性和功能性。本文研究了從印度鹽田中分離嗜鹽菌,并篩選其產(chǎn)生水解酶的能力。

樣本類型五個不同鹽田收集的土壤樣本

研究方法:通過不同濃度NaCl培養(yǎng)基分離嗜鹽菌,結(jié)合16S測序和生化測試進行鑒定,測試其水解酶活性。

研究結(jié)果:成功分離出多種嗜鹽菌株,篩選出具有高水解酶活性的菌株。這些菌株為工業(yè)酶開發(fā)提供重要資源。


不同鹽田中分離出的嗜鹽菌的純培養(yǎng)物 

 嗜鹽菌的顯微鏡觀察圖像

嗜鹽細菌菌株系統(tǒng)發(fā)育樹  

微基生物提供特定功能微生物菌株篩選與培養(yǎng)服務(wù),為您提供從樣本檢測到菌株純化、鑒定及功能驗證的全流程服務(wù),助力您的科研和應用項目的順利進展!

特定功能微生物菌株篩選與培養(yǎng),首發(fā)于微基生物

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根際/葉際微生物分離培養(yǎng) http://m.jungeng.cn/culture-isolation/isolation-and-cultivation-of-rhizosphere-microorganisms http://m.jungeng.cn/culture-isolation/isolation-and-cultivation-of-rhizosphere-microorganisms#comments Wed, 25 Jun 2025 08:26:16 +0000 http://m.jungeng.cn/?p=4911 根際微生物能夠促進植物生長、提高植物抗病能力,葉際微生物在植物病害防控和植物生長調(diào)節(jié)方面也具有重要作用。通過分離培養(yǎng)根際/葉際微生物,可以深入了解植物與微生物的相互作用機制...

根際/葉際微生物分離培養(yǎng),首發(fā)于微基生物。

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高效篩選、高通量測序、功能菌株篩選、全流程服務(wù)

服務(wù)簡介

根際微生物能夠促進植物生長、提高植物抗病能力,葉際微生物在植物病害防控和植物生長調(diào)節(jié)方面也具有重要作用。通過分離培養(yǎng)根際/葉際微生物,可以深入了解植物與微生物的相互作用機制,為農(nóng)業(yè)生產(chǎn)提供有益微生物資源。

微基生物提供根際/葉際微生物靶向/非靶向分離培養(yǎng)技術(shù),通過多種培養(yǎng)條件富集培養(yǎng)微生物,利用96孔板進行大規(guī)模分離和純化,得到大量純菌株。

服務(wù)亮點

高效篩選:高通量培養(yǎng)組學技術(shù)顯著提高篩選效率。多種培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件。

高通量測序:結(jié)合高通量深度測序技術(shù),提高微生物分離培養(yǎng)的效率和準確性。

功能菌株篩選:專注于篩選具有特定功能的微生物菌株。

全流程服務(wù)從樣本檢測到菌株純化、鑒定及擴繁,一站式解決客戶需求。

服務(wù)流程

1.樣本檢測

對原始樣本進行二代高通量測序,檢測樣本中微生物的種類及其相對豐度。

2.培養(yǎng)條件確定

確定多種培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件,盡可能多地富集培養(yǎng)樣本中的微生物。

3.微生物培養(yǎng)與純化

利用選定的培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件進行培養(yǎng),利用96孔板進行大規(guī)模的分離和純化。

4.菌種鑒定

對最終純化好的菌株進行基因水平的菌種鑒定,確認菌株的分類學屬性。

5.功能驗證

對篩選出的目標菌株進行功能驗證,確保其具備所需的特定功能。

樣本類型  

根際土壤樣本、根表樣本、葉片表面樣本等。

根際微生物取樣

1.抖落法:小心挖植物根系,輕輕抖動根系,使松散附著的土壤掉落,收集緊密附著在根系表面1-2mm厚的土壤,這部分土壤富含根際微生物。

2.沖洗法:將整株植物根系小心取出后,用無菌水輕柔沖洗,收集沖洗液,其中含有從根系表面洗脫的根際微生物。

葉際微生物取樣

1.擦拭法:使用無菌棉簽或紗布,輕輕擦拭葉片表面,將附著的微生物收集到棉簽或紗布上。操作時要注意避免損傷葉片,且需對不同部位葉片進行多點取樣,以保證樣本代表性。

2.振蕩法:把采集的葉片放入裝有無菌緩沖液的容器中,通過振蕩使葉際微生物從葉片表面脫離到緩沖液里。振蕩頻率和時間要嚴格控制,防止過度振蕩破壞微生物結(jié)構(gòu)。

樣本保存與寄送 

采集后的樣本需立即置于微生物活菌保存液中,盡快置于-80℃凍存。

所有樣本采集完成后,使用冰盒郵寄至檢測公司。

案例分享

番茄根際細菌的分離與鑒定(High-Throughput Detection of Siderophore Production of Rhizobacteria.2022)

本文分別從不同地區(qū)選取番茄植株,采集根際樣品,從中分離出大量可培養(yǎng)根際細菌,并利用16s rRNA測序技術(shù)對其鑒定分類。

樣本類型:非根際土壤、根際土壤

研究方法:通過16S rRNA測序和鐵載體檢測,分離并鑒定根際細菌。

研究結(jié)果成功分離和鑒定出2150株根際細菌,揭示了根際細菌的多樣性和分類特征。

為植物根際細菌的功能研究提供了豐富的資源。

番茄根際細菌的分離與鑒定示意圖  



2150株根際分離細菌的多樣性和分類



微基生物提供根際/葉際微生物分離培養(yǎng)服務(wù),提供從樣本檢測到菌株純化、鑒定及功能驗證的全流程服務(wù)!

根際/葉際微生物分離培養(yǎng),首發(fā)于微基生物。

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厭氧/腸道菌分離培養(yǎng) http://m.jungeng.cn/culture-isolation/intestinal-bacteria http://m.jungeng.cn/culture-isolation/intestinal-bacteria#comments Fri, 20 Jun 2025 08:51:50 +0000 http://m.jungeng.cn/?p=4909 腸道微生物參與消化、吸收、免疫調(diào)節(jié)等多個生理過程。通過分離培養(yǎng)腸道微生物,可以深入了解腸道微生物群落的組成和功能,為疾病診斷、治療以及個性化營養(yǎng)方案的制定提供依據(jù)...

厭氧/腸道菌分離培養(yǎng),首發(fā)于微基生物

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高效篩選、高通量測序、目標菌株篩選、全流程化服務(wù)

 

服務(wù)簡介腸道微生物參與消化、吸收、免疫調(diào)節(jié)等多個生理過程。通過分離培養(yǎng)腸道微生物,可以深入了解腸道微生物群落的組成和功能,為疾病診斷、治療以及個性化營養(yǎng)方案的制定提供依據(jù)。

微基生物提供腸道菌群需氧/厭氧、靶向/非靶向分離培養(yǎng)服務(wù)。結(jié)合高通量測序和培養(yǎng)技術(shù),幫助客戶獲取盡可能多的菌株及特定目標菌株。

服務(wù)亮點

高效篩選:采用多種培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件,高通量培養(yǎng)組學顯著提高篩選效率。

高通量測序:結(jié)合二代高通量深度測序技術(shù),提高微生物分離培養(yǎng)的效率和準確性。

目標菌株篩選:根據(jù)研究需求,靶向篩選具有特定功能及生物學分類的目標菌株。

全流程化服務(wù):從樣本檢測到菌株純化、鑒定及擴繁,一站式解決客戶需求。

服務(wù)流程

1.樣本檢測

對原始樣本進行二代高通量測序,檢測樣本中微生物的種類及其相對豐度。

2.培養(yǎng)條件確定

根據(jù)測序結(jié)果,確定目標菌株的培養(yǎng)條件和培養(yǎng)基。

3.微生物培養(yǎng)與純化

利用選定的培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件進行培養(yǎng),利用96孔板進行大規(guī)模的分離和純化。

4.菌種鑒定

對最終純化好的菌株進行基因水平的菌種鑒定,確認菌株的分類學屬性。

5.功能驗證

根據(jù)需要,對篩選出的目標菌株進行功能驗證。

樣本類型

糞便樣本、腸道組織樣本、動物糞便樣本等。

樣本保存和寄送

采集新鮮糞便樣本后,立即放入厭氧活菌保存液中。盡快置于-80℃凍存。

所有樣本采集完成后,在冰盒中郵寄至檢測公司。

案例分享

案例1:Isolation and Cultivation of Human Gut Microorganisms: A Review.2023

文獻綜述了人類腸道微生物的分離和培養(yǎng)策略,重點介紹了培養(yǎng)組學的非靶向和靶向策略。非靶向策略通過在多種培養(yǎng)基上培養(yǎng)樣本,盡可能多地分離微生物;靶向策略則利用分子生物學、生物信息學等技術(shù),針對特定微生物進行分選和培養(yǎng)。



 案例2:比較健康志愿者配對的糞便和直腸活檢樣本的微生物特征(Comparison of microbial signatures between paired faecal and rectal biopsy samples from healthy volunteers using next-generation sequencing and culturomics.2022)

文獻研究通過比較健康志愿者配對的糞便和黏膜微生物群的特征,以驗證糞便樣本是否可以作為直腸活檢相關(guān)微生物群的替代品。

樣本類型健康志愿者的糞便和直腸活檢樣本。

研究方法:通過細菌培養(yǎng)和16S測序,比較糞便與直腸活檢樣本的微生物特征。

研究結(jié)果:配對糞便和直腸活檢清洗樣本的細菌特征非常相似,驗證了糞便樣本作為直腸活檢相關(guān)微生物群的便捷替代品的用途。

不同糞便和直腸活檢樣本類型間微生物特征的比較  /屬級別



糞便和直腸活檢洗樣品間的物種多樣性比較 



樣本間細菌培養(yǎng)與測序結(jié)果對比圖


微基生物提供厭氧/腸道微生物分離培養(yǎng)服務(wù),提供從樣本檢測到菌株純化、鑒定及功能驗證的全流程服務(wù)!

厭氧/腸道菌分離培養(yǎng),首發(fā)于微基生物。

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土壤/環(huán)境微生物分離培養(yǎng) http://m.jungeng.cn/culture-isolation/soil-separation-cultivation http://m.jungeng.cn/culture-isolation/soil-separation-cultivation#comments Wed, 18 Jun 2025 08:46:09 +0000 http://m.jungeng.cn/?p=4908 土壤是微生物是養(yǎng)分循環(huán)、污染物降解、植物健康的核心參與者。通過分離培養(yǎng)土壤微生物,能夠深入了解土壤生態(tài)系統(tǒng)的功能和機制,為農(nóng)業(yè)、環(huán)境等領(lǐng)域提供科學依據(jù)...

土壤/環(huán)境微生物分離培養(yǎng),首發(fā)于微基生物。

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高效篩選、高通量測序、功能菌株篩選、全流程服務(wù)

服務(wù)簡介

土壤是微生物是養(yǎng)分循環(huán)、污染物降解、植物健康的核心參與者。通過分離培養(yǎng)土壤微生物,能夠深入了解土壤生態(tài)系統(tǒng)的功能和機制,為農(nóng)業(yè)、環(huán)境等領(lǐng)域提供科學依據(jù)。

微基生物提供土壤微生物的非靶向/靶向分離培養(yǎng)服務(wù),結(jié)合高通量測序技術(shù),檢測樣本中微生物的種類及其相對豐度,為后續(xù)研究提供基礎(chǔ)。

服務(wù)類型

非靶向分離培養(yǎng):采用多種培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件,盡可能多的分離得到樣品中的微生物。

靶向分離培養(yǎng):選用特定培養(yǎng)基,著重分離具有特定功能或生物學分類的目標微生物。

服務(wù)亮點

高效篩選:高通量培養(yǎng)組學技術(shù)顯著提高篩選效率。多種培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件。

高通量測序:結(jié)合高通量深度測序技術(shù),提高微生物分離培養(yǎng)的效率和準確性。

功能菌株篩選:專注于篩選具有特定功能的微生物菌株,滿足客戶多樣化需求。

全流程服務(wù):從樣本檢測到菌株純化、鑒定及功能驗證,一站式解決客戶問題。

服務(wù)流程

1.樣本檢測

通過二代高通量深度測序技術(shù),檢測樣本中微生物的種類及其相對豐度。

2.培養(yǎng)基與條件確定

查閱文獻和資料,確定多種培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件,確保盡可能多的培養(yǎng)純化菌株。

3.微生物培養(yǎng)與純化

利用選定的培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件對微生物進行培養(yǎng),利用96孔板進行大規(guī)模的分離和純化。

4.菌種鑒定

對最終純化好的菌株進行菌種鑒定,確認菌株的分類學屬性。

5.菌株擴繁

根據(jù)客戶的需求,對純化好的菌株進行擴繁培養(yǎng),提供足夠的菌株用于后續(xù)研究。

樣本類型

農(nóng)田土壤、森林土壤、濕地土壤等各類土壤樣本。              

樣本保存和寄送

樣本采集后立即放入厭氧/需氧活菌保存液中,盡快置于-80℃凍存

所有樣本采集完成后,使用冰盒郵寄至檢測公司。

案例分享

點擊這里訪問根際微生物、土壤微生物非靶向分離培養(yǎng)(大規(guī)模廣篩)頁面


土壤/環(huán)境微生物分離培養(yǎng),首發(fā)于微基生物。

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“菌譜?檢測——二代”:高性價比、大批量,菌群結(jié)構(gòu)16S二代測序檢測 http://m.jungeng.cn/culture-isolation/96-16s-rrna http://m.jungeng.cn/culture-isolation/96-16s-rrna#comments Tue, 08 Apr 2025 06:31:01 +0000 http://m.jungeng.cn/?p=4885 96孔板是一種常用于生物實驗的微孔板,允許同時進行大量的微生物培養(yǎng)和分析,從而實現(xiàn)高通量篩選和鑒定。16S rRNA的高通量鑒定可以增加獲得單一細菌的比例,有助于探索微生物群落的......

“菌譜?檢測——二代”:高性價比、大批量,菌群結(jié)構(gòu)16S二代測序檢測,首發(fā)于微基生物。

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單孔測序低至29.8元

適用樣本

96孔板中細菌培養(yǎng)物(純菌及混合菌皆可)、平板細菌菌落、批量培養(yǎng)物/菌液等需要批量檢測的

服務(wù)亮點

純菌及混合菌皆可檢測:可提供豐度高于0.1%的全部菌群結(jié)構(gòu)

超高性價比:單樣本菌群結(jié)構(gòu)檢測費用低至29.8元

保種無憂:檢測的同時可提供轉(zhuǎn)板、轉(zhuǎn)接及保種服務(wù),厭氧及需氧皆可

測序區(qū)域:16S V3-V4區(qū) 擴增子二代測序及分析

數(shù)據(jù)保障:每96孔板檢測序列數(shù)>10萬條,平均每孔>1000條序列數(shù)據(jù)

96孔板 細菌檢測流程圖

服務(wù)流程

1 樣本準備客戶需提供菌液或菌落。

2 DNA提取與質(zhì)量檢測:批量提取、檢測樣本細菌DNA

3 16S V3-V4區(qū)擴增:利用特異性引物,對16S rRNA基因V3-V4區(qū)進行PCR擴增。

4 文庫構(gòu)建與質(zhì)控PCR產(chǎn)物純化后連接測序接頭,構(gòu)建測序文庫,檢測文庫的插入片段大小和濃度。

5 高通量測序:采用二代測序平臺,對構(gòu)建好的文庫進行深度測序,獲取測序數(shù)據(jù)。

6 生信分析:對測序數(shù)據(jù)進行序列過濾、比對、物種注釋、OTU聚類和多樣性分析,生成詳細分析報告。

7 結(jié)果交付與解讀:以直觀易懂的圖表和文字形式交付分析報告,并提供專業(yè)的結(jié)果解讀服務(wù)。

詳細報告解讀 

直觀的96孔板餅圖展示

餅圖清晰呈現(xiàn)每個孔中微生物群落的組成比例和分布情況,了解各孔中不同微生物類群的相對含量。


詳細的 OTU 豐度匯總

突出顯示樣本中的優(yōu)勢微生物群體,幫助客戶快速鎖定研究重點微生物。

每個OTU對應的物種信息及相對豐度分析

清晰的了解樣本中微生物種類及每種微生物的相對含量變化。


菌液、菌落微生物鑒定技術(shù)對比表

維度

菌種鑒定(一代測序)

微生物質(zhì)譜鑒定

菌譜®檢測——二代測序

技術(shù)原理

Sanger法雙向測序,16S rRNA基因PCR產(chǎn)物測序

MALDI-TOF質(zhì)譜檢測核糖體蛋白指紋圖譜

二代高通量雙高變區(qū)(V3-V4)測序,結(jié)合生物信息學分析菌群結(jié)構(gòu)與物種豐度

核心優(yōu)勢

科研級單菌鑒定精度
(>99.9%
國際金標準方法

臨床常見菌快速鑒定

(<1小時)
常見菌種數(shù)據(jù)庫成熟

行業(yè)領(lǐng)先性價比:

單次檢測可分析10,000+樣本                 
混合菌解析能力:

精確識別0.1%豐度以上物種(可精準區(qū)分OTU/ASV,部分可分類到“種”,大部分分類到“屬”)

技術(shù)局限

僅限純菌鑒定                              

測序通量低(<96樣本/次)       

實驗人工操作多,人工看峰圖

無法分析菌群結(jié)構(gòu)

依賴純培養(yǎng)菌落

數(shù)據(jù)庫更新滯后

無法區(qū)分亞種/血清型                   
需結(jié)合代謝組分析功能活性

樣本要求

純培養(yǎng)菌落(單克?。?/span>

純培養(yǎng)菌落或單菌懸液

支持混合菌液、菌落、凍存菌株等復雜樣本

檢測通量

低(1-96樣本/批次)

中(數(shù)百樣本/天)

超高通量(10,000+樣本/次)

成本效益

單樣本成本數(shù)十以上

設(shè)備昂貴,單次檢測成本低數(shù)十元

批量檢測成本優(yōu)勢(¥29.8/樣本)

應用場景

科研級菌種鑒定                 
模式菌株保藏

臨床微生物快速鑒定
工業(yè)QC質(zhì)控
純菌鑒定

純菌、混合菌液及菌落的菌群群落分析,大批量

數(shù)據(jù)庫
優(yōu)勢

通用16S數(shù)據(jù)庫(NCBI等)

商業(yè)菌種數(shù)據(jù)庫(Bruker/Microflex等)

SILVA數(shù)據(jù)庫,定期更新

“菌譜?檢測——二代”:高性價比、大批量,菌群結(jié)構(gòu)16S二代測序檢測,首發(fā)于微基生物

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