特定功能微生物菌株篩選與培養(yǎng),首發(fā)于微基生物。
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在環(huán)境、能源、醫(yī)藥等眾多領(lǐng)域,通過篩選與培養(yǎng)具有特定功能的微生物菌株,可以為解決實際問題提供有效的微生物解決方案。
微基生物依托高通量培養(yǎng)組學技術(shù),結(jié)合多種培養(yǎng)條件和培養(yǎng)基,從復雜樣本中分離和篩選出具有降解污染物、固氮、解磷、產(chǎn)生物活性物質(zhì)等特定功能的微生物菌株,顯著提升篩選效率和成功率。
服務(wù)亮點
高效篩選:采用高通量培養(yǎng)組學技術(shù),快速鎖定目標菌株,大幅縮短篩選周期。
定向培養(yǎng):定制化培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件,滿足目標菌株的生長需求,確保高成功率。
功能菌株篩選:專注于篩選具有特定功能的微生物菌株,滿足客戶多樣化需求。
全流程服務(wù):從樣本檢測到菌株純化、鑒定及功能驗證,一站式解決客戶問題。
服務(wù)流程
1.樣本檢測
對原始樣本進行二代高通量測序,檢測樣本中微生物的種類及其相對豐度。
2.培養(yǎng)條件確定
根據(jù)客戶需求和測序結(jié)果,確定目標菌株的培養(yǎng)條件和培養(yǎng)基。
3.微生物培養(yǎng)與純化
利用選定的培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件進行培養(yǎng),利用96孔板進行大規(guī)模的分離和純化。
4.菌種鑒定
對最終純化好的菌株進行基因水平的菌種鑒定,確認菌株的分類學屬性。
5.功能驗證
對篩選出的目標菌株進行功能驗證,確保其具備所需的特定功能。
樣本類型
土壤、水體、動植物組織、極端環(huán)境樣本(熱泉、凍土、鹽湖)、工業(yè)發(fā)酵液等復雜基質(zhì)。
樣本保存和寄送
樣本采集后立即放入微生物活菌保存液中,盡快置于-80℃凍存。
所有樣本采集完成后,使用冰盒中郵寄至檢測公司。
案例分享
嗜鹽菌是一類能夠在高鹽環(huán)境中生存的微生物,其產(chǎn)生的水解酶在極端條件下(如高鹽、高溫、極端pH等)具有穩(wěn)定性和功能性。本文研究了從印度鹽田中分離嗜鹽菌,并篩選其產(chǎn)生水解酶的能力。
樣本類型:五個不同鹽田收集的土壤樣本
研究方法:通過不同濃度NaCl培養(yǎng)基分離嗜鹽菌,結(jié)合16S測序和生化測試進行鑒定,測試其水解酶活性。
研究結(jié)果:成功分離出多種嗜鹽菌株,篩選出具有高水解酶活性的菌株。這些菌株為工業(yè)酶開發(fā)提供重要資源。
不同鹽田中分離出的嗜鹽菌的純培養(yǎng)物
嗜鹽菌的顯微鏡觀察圖像
嗜鹽細菌菌株系統(tǒng)發(fā)育樹
微基生物提供特定功能微生物菌株篩選與培養(yǎng)服務(wù),為您提供從樣本檢測到菌株純化、鑒定及功能驗證的全流程服務(wù),助力您的科研和應用項目的順利進展!
特定功能微生物菌株篩選與培養(yǎng),首發(fā)于微基生物。
]]>根際/葉際微生物分離培養(yǎng),首發(fā)于微基生物。
]]>服務(wù)簡介
根際微生物能夠促進植物生長、提高植物抗病能力,葉際微生物在植物病害防控和植物生長調(diào)節(jié)方面也具有重要作用。通過分離培養(yǎng)根際/葉際微生物,可以深入了解植物與微生物的相互作用機制,為農(nóng)業(yè)生產(chǎn)提供有益微生物資源。
微基生物提供根際/葉際微生物靶向/非靶向分離培養(yǎng)技術(shù),通過多種培養(yǎng)條件富集培養(yǎng)微生物,利用96孔板進行大規(guī)模分離和純化,得到大量純菌株。
服務(wù)亮點
高效篩選:高通量培養(yǎng)組學技術(shù)顯著提高篩選效率。多種培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件。
高通量測序:結(jié)合高通量深度測序技術(shù),提高微生物分離培養(yǎng)的效率和準確性。
功能菌株篩選:專注于篩選具有特定功能的微生物菌株。
全流程服務(wù):從樣本檢測到菌株純化、鑒定及擴繁,一站式解決客戶需求。
服務(wù)流程
1.樣本檢測
對原始樣本進行二代高通量測序,檢測樣本中微生物的種類及其相對豐度。
2.培養(yǎng)條件確定
確定多種培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件,盡可能多地富集培養(yǎng)樣本中的微生物。
3.微生物培養(yǎng)與純化
利用選定的培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件進行培養(yǎng),利用96孔板進行大規(guī)模的分離和純化。
4.菌種鑒定
對最終純化好的菌株進行基因水平的菌種鑒定,確認菌株的分類學屬性。
5.功能驗證
對篩選出的目標菌株進行功能驗證,確保其具備所需的特定功能。
樣本類型
根際土壤樣本、根表樣本、葉片表面樣本等。
根際微生物取樣
1.抖落法:小心挖取植物根系,輕輕抖動根系,使松散附著的土壤掉落,收集緊密附著在根系表面1-2mm厚的土壤,這部分土壤富含根際微生物。
2.沖洗法:將整株植物根系小心取出后,用無菌水輕柔沖洗,收集沖洗液,其中含有從根系表面洗脫的根際微生物。
葉際微生物取樣
1.擦拭法:使用無菌棉簽或紗布,輕輕擦拭葉片表面,將附著的微生物收集到棉簽或紗布上。操作時要注意避免損傷葉片,且需對不同部位葉片進行多點取樣,以保證樣本代表性。
2.振蕩法:把采集的葉片放入裝有無菌緩沖液的容器中,通過振蕩使葉際微生物從葉片表面脫離到緩沖液里。振蕩頻率和時間要嚴格控制,防止過度振蕩破壞微生物結(jié)構(gòu)。
樣本保存與寄送
采集后的樣本需立即置于微生物活菌保存液中,盡快置于-80℃凍存。
所有樣本采集完成后,使用冰盒郵寄至檢測公司。
案例分享
番茄根際細菌的分離與鑒定(High-Throughput Detection of Siderophore Production of Rhizobacteria.2022)
本文分別從不同地區(qū)選取番茄植株,采集根際樣品,從中分離出大量可培養(yǎng)根際細菌,并利用16s rRNA測序技術(shù)對其鑒定分類。
樣本類型:非根際土壤、根際土壤
研究方法:通過16S rRNA測序和鐵載體檢測,分離并鑒定根際細菌。
研究結(jié)果:成功分離和鑒定出2150株根際細菌,揭示了根際細菌的多樣性和分類特征。
為植物根際細菌的功能研究提供了豐富的資源。
番茄根際細菌的分離與鑒定示意圖

2150株根際分離細菌的多樣性和分類
微基生物提供根際/葉際微生物分離培養(yǎng)服務(wù),提供從樣本檢測到菌株純化、鑒定及功能驗證的全流程服務(wù)!
根際/葉際微生物分離培養(yǎng),首發(fā)于微基生物。
]]>厭氧/腸道菌分離培養(yǎng),首發(fā)于微基生物。
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服務(wù)簡介腸道微生物參與消化、吸收、免疫調(diào)節(jié)等多個生理過程。通過分離培養(yǎng)腸道微生物,可以深入了解腸道微生物群落的組成和功能,為疾病診斷、治療以及個性化營養(yǎng)方案的制定提供依據(jù)。
微基生物提供腸道菌群微需氧/厭氧、靶向/非靶向分離培養(yǎng)服務(wù)。結(jié)合高通量測序和培養(yǎng)技術(shù),幫助客戶獲取盡可能多的菌株及特定目標菌株。
服務(wù)亮點
高效篩選:采用多種培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件,高通量培養(yǎng)組學顯著提高篩選效率。
高通量測序:結(jié)合二代高通量深度測序技術(shù),提高微生物分離培養(yǎng)的效率和準確性。
目標菌株篩選:根據(jù)研究需求,靶向篩選具有特定功能及生物學分類的目標菌株。
全流程化服務(wù):從樣本檢測到菌株純化、鑒定及擴繁,一站式解決客戶需求。
服務(wù)流程
1.樣本檢測
對原始樣本進行二代高通量測序,檢測樣本中微生物的種類及其相對豐度。
2.培養(yǎng)條件確定
根據(jù)測序結(jié)果,確定目標菌株的培養(yǎng)條件和培養(yǎng)基。
3.微生物培養(yǎng)與純化
利用選定的培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件進行培養(yǎng),利用96孔板進行大規(guī)模的分離和純化。
4.菌種鑒定
對最終純化好的菌株進行基因水平的菌種鑒定,確認菌株的分類學屬性。
5.功能驗證
根據(jù)需要,對篩選出的目標菌株進行功能驗證。
樣本類型
糞便樣本、腸道組織樣本、動物糞便樣本等。
樣本保存和寄送
采集新鮮糞便樣本后,立即放入厭氧活菌保存液中。盡快置于-80℃凍存。
所有樣本采集完成后,在冰盒中郵寄至檢測公司。
案例分享
案例1:Isolation and Cultivation of Human Gut Microorganisms: A Review.2023
文獻綜述了人類腸道微生物的分離和培養(yǎng)策略,重點介紹了培養(yǎng)組學的非靶向和靶向策略。非靶向策略通過在多種培養(yǎng)基上培養(yǎng)樣本,盡可能多地分離微生物;靶向策略則利用分子生物學、生物信息學等技術(shù),針對特定微生物進行分選和培養(yǎng)。


案例2:比較健康志愿者配對的糞便和直腸活檢樣本的微生物特征(Comparison of microbial signatures between paired faecal and rectal biopsy samples from healthy volunteers using next-generation sequencing and culturomics.2022)
文獻研究通過比較健康志愿者配對的糞便和黏膜微生物群的特征,以驗證糞便樣本是否可以作為直腸活檢相關(guān)微生物群的替代品。
樣本類型:健康志愿者的糞便和直腸活檢樣本。
研究方法:通過細菌培養(yǎng)和16S測序,比較糞便與直腸活檢樣本的微生物特征。
研究結(jié)果:配對糞便和直腸活檢清洗樣本的細菌特征非常相似,驗證了糞便樣本作為直腸活檢相關(guān)微生物群的便捷替代品的用途。
不同糞便和直腸活檢樣本類型間微生物特征的比較 門/屬級別


糞便和直腸活檢沖洗樣品間的物種多樣性比較


厭氧/腸道菌分離培養(yǎng),首發(fā)于微基生物。
]]>土壤/環(huán)境微生物分離培養(yǎng),首發(fā)于微基生物。
]]>服務(wù)簡介
土壤是微生物是養(yǎng)分循環(huán)、污染物降解、植物健康的核心參與者。通過分離培養(yǎng)土壤微生物,能夠深入了解土壤生態(tài)系統(tǒng)的功能和機制,為農(nóng)業(yè)、環(huán)境等領(lǐng)域提供科學依據(jù)。
微基生物提供土壤微生物的非靶向/靶向分離培養(yǎng)服務(wù),結(jié)合高通量測序技術(shù),檢測樣本中微生物的種類及其相對豐度,為后續(xù)研究提供基礎(chǔ)。
服務(wù)類型
非靶向分離培養(yǎng):采用多種培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件,盡可能多的分離得到樣品中的微生物。
靶向分離培養(yǎng):選用特定培養(yǎng)基,著重分離具有特定功能或生物學分類的目標微生物。
服務(wù)亮點
高效篩選:高通量培養(yǎng)組學技術(shù)顯著提高篩選效率。多種培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件。
高通量測序:結(jié)合高通量深度測序技術(shù),提高微生物分離培養(yǎng)的效率和準確性。
功能菌株篩選:專注于篩選具有特定功能的微生物菌株,滿足客戶多樣化需求。
全流程服務(wù):從樣本檢測到菌株純化、鑒定及功能驗證,一站式解決客戶問題。
服務(wù)流程
1.樣本檢測
通過二代高通量深度測序技術(shù),檢測樣本中微生物的種類及其相對豐度。
2.培養(yǎng)基與條件確定
查閱文獻和資料,確定多種培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件,確保盡可能多的培養(yǎng)純化菌株。
3.微生物培養(yǎng)與純化
利用選定的培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件對微生物進行培養(yǎng),利用96孔板進行大規(guī)模的分離和純化。
4.菌種鑒定
對最終純化好的菌株進行菌種鑒定,確認菌株的分類學屬性。
5.菌株擴繁
根據(jù)客戶的需求,對純化好的菌株進行擴繁培養(yǎng),提供足夠的菌株用于后續(xù)研究。
樣本類型
農(nóng)田土壤、森林土壤、濕地土壤等各類土壤樣本。
樣本保存和寄送
樣本采集后立即放入厭氧/需氧活菌保存液中,盡快置于-80℃凍存。
所有樣本采集完成后,使用冰盒郵寄至檢測公司。
案例分享
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土壤/環(huán)境微生物分離培養(yǎng),首發(fā)于微基生物。
]]>單孔測序低至29.8元
適用樣本
96孔板中細菌培養(yǎng)物(純菌及混合菌皆可)、平板細菌菌落、批量培養(yǎng)物/菌液等需要批量檢測的
服務(wù)亮點
純菌及混合菌皆可檢測:可提供豐度高于0.1%的全部菌群結(jié)構(gòu)
超高性價比:單樣本菌群結(jié)構(gòu)檢測費用低至29.8元
保種無憂:檢測的同時可提供轉(zhuǎn)板、轉(zhuǎn)接及保種服務(wù),厭氧及需氧皆可
測序區(qū)域:16S V3-V4區(qū) 擴增子二代測序及分析
數(shù)據(jù)保障:每96孔板檢測序列數(shù)>10萬條,平均每孔>1000條序列數(shù)據(jù)
96孔板 細菌檢測流程圖
服務(wù)流程
1 樣本準備:客戶需提供菌液或菌落。
2 DNA提取與質(zhì)量檢測:批量提取、檢測樣本細菌DNA
3 16S V3-V4區(qū)擴增:利用特異性引物,對16S rRNA基因V3-V4區(qū)進行PCR擴增。
4 文庫構(gòu)建與質(zhì)控:對PCR產(chǎn)物純化后連接測序接頭,構(gòu)建測序文庫,檢測文庫的插入片段大小和濃度。
5 高通量測序:采用二代測序平臺,對構(gòu)建好的文庫進行深度測序,獲取測序數(shù)據(jù)。
6 生信分析:對測序數(shù)據(jù)進行序列過濾、比對、物種注釋、OTU聚類和多樣性分析,生成詳細分析報告。
7 結(jié)果交付與解讀:以直觀易懂的圖表和文字形式交付分析報告,并提供專業(yè)的結(jié)果解讀服務(wù)。
詳細報告解讀
直觀的96孔板餅圖展示
餅圖清晰呈現(xiàn)每個孔中微生物群落的組成比例和分布情況,了解各孔中不同微生物類群的相對含量。
詳細的 OTU 豐度匯總
突出顯示樣本中的優(yōu)勢微生物群體,幫助客戶快速鎖定研究重點微生物。
每個OTU對應的物種信息及相對豐度分析
清晰的了解樣本中微生物種類及每種微生物的相對含量變化。

菌液、菌落微生物鑒定技術(shù)對比表
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維度 |
菌種鑒定(一代測序) |
微生物質(zhì)譜鑒定 |
菌譜®檢測——二代測序 |
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技術(shù)原理 |
Sanger法雙向測序,16S rRNA基因PCR產(chǎn)物測序 |
MALDI-TOF質(zhì)譜檢測核糖體蛋白指紋圖譜 |
二代高通量雙高變區(qū)(V3-V4)測序,結(jié)合生物信息學分析菌群結(jié)構(gòu)與物種豐度 |
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核心優(yōu)勢 |
科研級單菌鑒定精度 |
臨床常見菌快速鑒定
(<1小時) |
行業(yè)領(lǐng)先性價比:
單次檢測可分析10,000+樣本 精確識別0.1%豐度以上物種(可精準區(qū)分OTU/ASV,部分可分類到“種”,大部分分類到“屬”) |
|
技術(shù)局限 |
僅限純菌鑒定 測序通量低(<96樣本/次) 實驗人工操作多,人工看峰圖 |
無法分析菌群結(jié)構(gòu) 依賴純培養(yǎng)菌落 數(shù)據(jù)庫更新滯后 |
無法區(qū)分亞種/血清型 |
|
樣本要求 |
純培養(yǎng)菌落(單克?。?/span> |
純培養(yǎng)菌落或單菌懸液 |
支持混合菌液、菌落、凍存菌株等復雜樣本 |
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檢測通量 |
低(1-96樣本/批次) |
中(數(shù)百樣本/天) |
超高通量(10,000+樣本/次) |
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成本效益 |
單樣本成本數(shù)十以上 |
設(shè)備昂貴,單次檢測成本低數(shù)十元 |
批量檢測成本優(yōu)勢(¥29.8/樣本) |
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應用場景 |
科研級菌種鑒定 |
臨床微生物快速鑒定 |
純菌、混合菌液及菌落的菌群群落分析,大批量 |
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數(shù)據(jù)庫 |
通用16S數(shù)據(jù)庫(NCBI等) |
商業(yè)菌種數(shù)據(jù)庫(Bruker/Microflex等) |
SILVA數(shù)據(jù)庫,定期更新 |
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