RDA 或CCA 模型的選擇原則：先用species-sample 數(shù)據(jù)（97%相似性的樣品OTU 表）做DCA 分析，看分析結(jié)果中Lengths of gradient 的第一軸的大小，如果大于4.0，就應該選CCA，如果3.0-4.0 之間，選RDA 和CCA均可，如果小于3.0，RDA 的結(jié)果要好于CCA。
軟件：PC-ORD或是CANOCO軟件作圖。
參考文獻：
Sheik CS, Mitchell TW, Rizvi FZ, Rehman Y, Faisal M, et al. (2012) Exposure of Soil Microbial
Communities to Chromium and Arsenic Alters Their Diversity and Structure. PLoS ONE 7(6): e40059.doi:10.1371/journal.pone.0040059.
例圖：
基于OTU進行RDA /CCA分析
基于物種信息進行RDA /CCA分析
注：圖中數(shù)字表示樣品名，不同顏色或形狀表示不同環(huán)境或條件下的樣本組；箭頭表示環(huán)境因子；圖中藍色上三角表示不同屬的細菌；物種與環(huán)境因子之間的夾角代表物種與環(huán)境因子間的正、負相關關系（銳角：正相關；鈍角：負相關；直角：無相關性）；由不同的樣本向各環(huán)境因子做垂線，投影點越相近說明樣本間該環(huán)境因子屬性值越相似，即環(huán)境因子對樣品的影響程度相當。
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