多重qPCR引物/探針對設(shè)計(jì),首發(fā)于微基生物。
]]>服務(wù)簡介
多重?zé)晒舛?/span>PCR(Multiple fluorescencequantitative PCR)技術(shù)是在熒光定量PCR技術(shù)的基礎(chǔ)上,利用幾種不同熒光基團(tuán)的組合,結(jié)合儀器對不同通道熒光的檢測能力實(shí)現(xiàn)對多個(gè)靶標(biāo)的實(shí)時(shí)定量檢測。引物和探針的特異性是多重qPCR實(shí)驗(yàn)的關(guān)鍵。
微基生物為客戶提供高質(zhì)量的多重qPCR引物、探針對設(shè)計(jì)服務(wù)。針對多個(gè)目標(biāo)菌株或微生物種類,設(shè)計(jì)多重qPCR引物和探針組合,實(shí)現(xiàn)同時(shí)檢測多個(gè)目標(biāo)微生物,提高檢測效率和準(zhǔn)確性。
服務(wù)亮點(diǎn)
高效檢測:能夠同時(shí)檢測多個(gè)靶標(biāo),有效節(jié)省時(shí)間和成本。
準(zhǔn)確定量:高特異性和靈敏度,確保檢測結(jié)果的準(zhǔn)確性。
定制化服務(wù):根據(jù)客戶需求設(shè)計(jì)個(gè)性化的引物/探針對組合。
全流程服務(wù):從設(shè)計(jì)到驗(yàn)證的全流程服務(wù),助力實(shí)驗(yàn)順利進(jìn)行。
服務(wù)流程
1.目標(biāo)基因序列分析
收集并分析目標(biāo)微生物或基因的序列信息,確定保守區(qū)域。
2.引物和探針設(shè)計(jì)
根據(jù)保守區(qū)域設(shè)計(jì)特異性引物和探針,確保相同反應(yīng)條件下具有良好的擴(kuò)增效率和特異性。
3.實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證
實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證引物和探針的擴(kuò)增效率和特異性,優(yōu)化反應(yīng)條件,確保檢測結(jié)果的可靠性。
4.結(jié)果分析與報(bào)告
對檢測結(jié)果進(jìn)行分析,提供詳細(xì)分析報(bào)告。
客戶提供信息
提供多個(gè)目標(biāo)微生物或基因的相關(guān)信息,包括物種名稱、基因名稱等。
案例分享
Multiplex TaqMan qPCR Assay for Detection, Identification, and Quantification of Three Sclerotinia Species.2022
開發(fā)一種能夠同時(shí)檢測、鑒定和定量三種核盤菌的多重TaqMan qPCR檢測方法。該方法通過設(shè)計(jì)針對每種核盤菌的特異性TaqMan引物/探針組合,實(shí)現(xiàn)了這三種真菌的高效檢測。
樣本類型:菌核樣本、土壤樣本以及純培養(yǎng)物。
研究結(jié)果
1. 該方法實(shí)現(xiàn)了三種核盤菌的高效檢測,具有高特異性和靈敏度。
2. 適用于不同類型的樣本檢測,為核盤菌病害的早期診斷和防控提供了有力工具。
用于檢測核盤菌屬物種的 TaqMan 檢測引物和探針的設(shè)計(jì)
單重和多重TaqMan qPCR檢測核盤菌的特異性
多重qPCR檢測的標(biāo)準(zhǔn)曲線
微基生物團(tuán)隊(duì)擁有豐富的多重qPCR設(shè)計(jì)和優(yōu)化經(jīng)驗(yàn),提供多重qPCR引物/探針對設(shè)計(jì)的全流程服務(wù),全方位的技術(shù)支持,確保您實(shí)驗(yàn)的順利進(jìn)行。
多重qPCR引物/探針對設(shè)計(jì),首發(fā)于微基生物。
]]>特定微生物菌群超多重tNGS設(shè)計(jì)檢測,首發(fā)于微基生物。
]]>服務(wù)亮點(diǎn)
精準(zhǔn)富集與檢測:結(jié)合超多重 PCR 擴(kuò)增或靶向捕獲技術(shù)與高通量測序,精準(zhǔn)富集目標(biāo)微生物基因序列,實(shí)現(xiàn)高效精準(zhǔn)檢測。
高靈敏度與特異性:靶向檢測特定微生物特定基因,通過多重PCR擴(kuò)增富集核酸序列提高檢測靈敏度,特異性探針/引物設(shè)計(jì)減少非目標(biāo)序列干擾,保證準(zhǔn)確性。
全面覆蓋與多重檢測:能同時(shí)檢測多種微生物,涵蓋細(xì)菌、病毒、真菌、寄生蟲等類型,全面分析復(fù)雜微生物群落。
廣泛適用與定制:適用于多種微生物檢測需求,包括環(huán)境微生物監(jiān)測、臨床樣本病原微生物檢測等,可根據(jù)需求定制探針/引物和檢測方案。
檢測原理
tNGS(靶向測序)結(jié)合超多重PCR擴(kuò)增或靶向捕獲技術(shù)與高通量測序。
引物設(shè)計(jì)與多重PCR擴(kuò)增:根據(jù)特定微生物菌群的基因組信息,利用生物信息學(xué)工具設(shè)計(jì)特異性探針/引物。通過多重PCR技術(shù)同時(shí)擴(kuò)增多個(gè)目標(biāo)基因片段,富集微生物核酸序列。
高通量測序與生物信息學(xué)分析:對擴(kuò)增得到的DNA片段進(jìn)行高通量測序,結(jié)合生物信息學(xué)分析比對數(shù)據(jù)庫,鑒定微生物種類及其基因特征,實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)檢測與分析。
樣本類型
臨床樣本:血液、鼻/咽拭子、痰液、尿液、糞便、腦脊液、穿刺液等。
環(huán)境樣本:土壤、水體、空氣、食品等。
其他生物樣本:動(dòng)植物組織
特定微生物菌群超多重tNGS設(shè)計(jì)檢測,首發(fā)于微基生物。
]]>菌株特異性TaqMan探針/引物設(shè)計(jì),首發(fā)于微基生物。
]]>
服務(wù)簡介
針對特定微生物菌株定量檢測,微基生物提供基于全基因組序列的菌株特異性TaqMan探針/引物設(shè)計(jì)、合成及驗(yàn)證服務(wù),確保探針/引物的高特異性和擴(kuò)增效率,滿足復(fù)雜微生物群落背景下的單菌株檢測需求。
1.高特異性與靈敏度
全基因組比對和優(yōu)化設(shè)計(jì),確保引物/探針僅與目標(biāo)序列高度匹配,避免非特異性擴(kuò)增。
2.靈活的檢測方法
提供qPCR探針法和液滴數(shù)字PCR(ddPCR)技術(shù)方案,滿足不同樣本類型和研究需求。
3.全流程服務(wù)
數(shù)據(jù)庫構(gòu)建到引物/探針設(shè)計(jì)、驗(yàn)證與優(yōu)化,再到大規(guī)模檢測,一站式解決實(shí)驗(yàn)需求。
4.可靠的數(shù)據(jù)支持
嚴(yán)格的質(zhì)量控制和優(yōu)化流程,確保實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性和可重復(fù)性。
服務(wù)流程
1.數(shù)據(jù)庫構(gòu)建
通過查詢菌株的序列信息,構(gòu)建該菌株的全基因組數(shù)據(jù)庫。
2.特異性引物/探針設(shè)計(jì)
利用生物信息學(xué)工具,設(shè)計(jì)針對目標(biāo)菌株的特異性引物或探針。
3.驗(yàn)證及優(yōu)化
合成設(shè)計(jì)好的引物,并進(jìn)行特異性、擴(kuò)增效率等驗(yàn)證和優(yōu)化。
4.大規(guī)模檢測
使用驗(yàn)證通過的引物進(jìn)行菌株特異性進(jìn)行大規(guī)模檢測。
1.TaqMan qPCR探針法
利用與目標(biāo)菌株核酸序列特異性結(jié)合的探針,提高檢測靈敏度和特異性。
驗(yàn)證方法:通過分析特異性、靈敏度和重復(fù)性來驗(yàn)證引物和探針。使用已知含目標(biāo)菌株DNA的樣本檢測特異性;稀釋目標(biāo)DNA模板測靈敏度;重復(fù)實(shí)驗(yàn)計(jì)算Ct值和標(biāo)準(zhǔn)差評估重復(fù)性。
3.ddPCR定量檢測
將反應(yīng)體系分割成大量納升液滴,每個(gè)液滴獨(dú)立進(jìn)行PCR反應(yīng),通過陽性和陰性液滴數(shù)量比計(jì)算目標(biāo)核酸絕對拷貝數(shù)。
驗(yàn)證方法:通過與傳統(tǒng)培養(yǎng)法或qPCR法比較驗(yàn)證ddPCR引物和探針。將ddPCR結(jié)果與培養(yǎng)法計(jì)數(shù)結(jié)果比較,評估準(zhǔn)確性;與qPCR法比較,分析相關(guān)性和一致性,同時(shí)分析重復(fù)實(shí)驗(yàn)液滴數(shù)量分布和標(biāo)準(zhǔn)差評估重復(fù)性。
客戶提供信息
提供該菌株的拉丁文全名。提供菌株的測序結(jié)果(建議提供全序列而非16S全長序列)。
案例分享
案例1:艱難梭菌毒素基因的絕對定量檢測(Establishment and application of absolute quantitative PCR method for tedA and tcdB genes of Clostridioides difficile.2025)
通過對產(chǎn)毒性艱難梭菌的tedA和tcdB基因進(jìn)行特異性引物和探針設(shè)計(jì),結(jié)合qPCR技術(shù),實(shí)現(xiàn)對產(chǎn)毒性艱難梭菌的高靈敏度和特異性的定量檢測。該方法具有線性范圍廣、靈敏性高、特異性和可重復(fù)性良好等特點(diǎn)。
案例2:ddPCR系統(tǒng)在病原微生物檢測中的應(yīng)用(Qualitative and quantitative detection of surgical pathogenic microorganisms Escherichia coli and Staphylococcus aureus based on ddPCR system.2021)
利用微滴數(shù)字PCR(ddPCR)系統(tǒng)對外科病原微生物大腸桿菌和金黃色葡萄球菌進(jìn)行定性和定量檢測。通過設(shè)計(jì)針對特定基因的引物和探針,結(jié)合ddPCR技術(shù)實(shí)現(xiàn)高精度定量檢測。研究證明ddPCR系統(tǒng)在血液樣本中具有極高的檢測準(zhǔn)確性。
ddPCR系統(tǒng)同時(shí)檢測模擬細(xì)菌血樣(大腸桿菌ATCC25922和金黃色葡萄球菌ATCC25923)的定量結(jié)果。
菌株特異性TaqMan探針/引物設(shè)計(jì)及驗(yàn)證是微生物檢測與定量研究的關(guān)鍵,qPCR探針法、ddPCR技術(shù)各有特點(diǎn),適用于不同場景下的菌株檢測與定量分析。
菌株特異性TaqMan探針/引物設(shè)計(jì),首發(fā)于微基生物。
]]>菌種/屬特異性TaqMan探針/引物設(shè)計(jì),首發(fā)于微基生物。
]]>在微生物組學(xué)研究中,準(zhǔn)確檢測和定量分析目標(biāo)菌屬或菌種是揭示微生物群落功能機(jī)制的關(guān)鍵。微基生物依托先進(jìn)的生物信息學(xué)技術(shù)和豐富的實(shí)驗(yàn)經(jīng)驗(yàn),提供基于全基因組序列的菌種/屬特異性TaqMan探針/引物設(shè)計(jì)、合成及驗(yàn)證服務(wù)。從而實(shí)現(xiàn)在復(fù)雜的微生物群落背景下實(shí)現(xiàn)單菌種級別的絕對定量。
1.高特異性與靈敏度
全基因組比對和優(yōu)化設(shè)計(jì),確保探針/引物僅與目標(biāo)序列高度匹配,避免非特異性擴(kuò)增。
2.靈活的檢測方法
提供qPCR探針法和液滴數(shù)字PCR(ddPCR)等檢測方法,滿足不同樣本類型和研究需求。
3.全流程服務(wù)
數(shù)據(jù)庫構(gòu)建到探針/引物設(shè)計(jì)、驗(yàn)證與優(yōu)化,再到大規(guī)模檢測,一站式解決實(shí)驗(yàn)需求。
4.可靠的數(shù)據(jù)支持
嚴(yán)格的質(zhì)量控制和優(yōu)化流程,確保實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性和可重復(fù)性。
服務(wù)流程
1.數(shù)據(jù)庫構(gòu)建
查詢菌種/屬的序列信息,構(gòu)建全基因組數(shù)據(jù)庫。
2.引物/探針設(shè)計(jì)
利用生物信息學(xué)工具,設(shè)計(jì)特異性引物或探針。
3.驗(yàn)證與優(yōu)化
合成設(shè)計(jì)好的引物或探針,并進(jìn)行特異性、擴(kuò)增效率等驗(yàn)證和優(yōu)化。
4.大規(guī)模檢測
使用驗(yàn)證通過的引物或探針對目標(biāo)菌種/屬進(jìn)行大規(guī)模檢測。
qPCR TaqMan探針檢測方法
微基生物提供基于TaqMan探針的qPCR探針/引物設(shè)計(jì)服務(wù)。確保探針與目標(biāo)序列特異性結(jié)合,通過Taq酶水解探針產(chǎn)生可檢測的熒光信號。優(yōu)化Tm值和長度,提高擴(kuò)增效率和特異性。
qPCR TaqMan探針法
液滴數(shù)字PCR(ddPCR)法
微基生物提供基于液滴數(shù)字PCR(ddPCR)的探針/引物設(shè)計(jì)服務(wù)。無需標(biāo)準(zhǔn)曲線,直接對目標(biāo)菌種進(jìn)行絕對定量分析。特別適用于臨床樣本、環(huán)境樣本及低豐度菌種的檢測。
客戶提供信息
目標(biāo)菌種/屬的拉丁文全名。
目標(biāo)菌種的全基因組序列或靶標(biāo)基因序列。
案例分享
Detecting and quantifying Veillonella by real-time quantitative PCR and droplet digital PCR.(2024年)
針對維洛內(nèi)拉菌(Veillonella)低豐度樣本的檢測需求,設(shè)計(jì)特異性引物和探針,評估qPCR和ddPCR方法的特異性和敏感性。
研究方法
1.基于16S rRNA基因序列設(shè)計(jì)引物和探針,進(jìn)行qPCR和ddPCR檢測。
2.使用模擬臨床樣本測試兩種方法的特異性和靈敏度。
3.收集炎癥性腸病(IBD)患者的臨床樣本,驗(yàn)證檢測系統(tǒng)的有效性。
研究結(jié)果
1.qPCR的檢測靈敏度100拷貝/μL,能夠準(zhǔn)確檢測103到108CFU/mL的Veillonella濃度。
2.ddPCR的檢測靈敏度為11.3拷貝/μL,適合檢測101到104CFU/mL的低豐度樣本。
3.臨床樣本中,qPCR和ddPCR的檢測結(jié)果與平板計(jì)數(shù)法一致,驗(yàn)證了檢測系統(tǒng)的準(zhǔn)確性。
4.通過ddPCR檢測到的Veillonella種類包括V.dispar、V.nakazawae和V.rodentium。
qPCR檢測的靈敏度和特異性結(jié)果
ddPCR檢測的靈敏度和特異性結(jié)果

qPCR和ddPCR均適用于檢測和定量維洛內(nèi)拉菌,其中qPCR更適合檢測較高豐度的樣本,而ddPCR更適合檢測低豐度的樣本。
微基生物致力于為微生物研究提供全面、高效的解決方案。選擇菌種/屬特異性TaqMan探針/引物設(shè)計(jì)與檢測服務(wù),讓您的實(shí)驗(yàn)更高效、更可靠!
菌種/屬特異性TaqMan探針/引物設(shè)計(jì),首發(fā)于微基生物。
]]>急速定制:格微?菌種特異性qPCR探針檢測試劑盒,首發(fā)于微基生物。
]]>微基生物目前已完成兩百余種特定菌種qPCR/dPCR探針法檢測試劑盒開發(fā)。涵蓋了眾多在醫(yī)學(xué)、食品、環(huán)境、工業(yè)等領(lǐng)域具有重要研究價(jià)值和應(yīng)用意義的微生物菌種。
l需求提交:客戶只需提供特定菌種拉丁名,格微®的專業(yè)團(tuán)隊(duì)將迅速啟動(dòng)定制流程。
l5個(gè)工作日內(nèi):完成對新檢測菌種的系統(tǒng)評估。
l急速定制:評估通過后,即可下單定制,起訂量僅為2份(共200次)試劑盒。
l20個(gè)工作日內(nèi):確保交付高質(zhì)量的試劑盒產(chǎn)品。
部分菌種特異性qPCR探針引物評估列表
|
序號 |
菌種名稱 |
拉丁名 |
該菌種已知菌株基因組個(gè)數(shù) |
單靶基因覆蓋率 |
多靶基因覆蓋率 |
|
1 |
木糖氧化無色桿菌 |
Achromobacter xylosoxidans |
169 |
91.1% |
2靶基因,97.1% |
|
2 |
鮑曼不動(dòng)桿菌 |
Acinetobacter baumannii |
9848 |
99.8% |
/ |
|
3 |
嗜水氣單胞菌 |
Aeromonas hydrophila |
446 |
100.0% |
/ |
|
4 |
產(chǎn)堿桿菌 |
Alcaligenes spp. |
103 |
97.1% |
/ |
|
5 |
蠟樣芽孢桿菌 |
Bacillus cereus |
2113 |
99.8% |
/ |
|
6 |
泡囊短波單胞菌 |
Brevundimonas vesicularis |
11 |
100.0% |
/ |
|
7 |
洋蔥伯克霍爾德菌群 |
Burkholderia cepacia complex |
2894 |
98.2% |
/ |
|
8 |
都柏林克羅諾桿菌 |
Cronobacter dublinensis |
126 |
100.0% |
/ |
|
9 |
阪崎腸桿菌 |
Cronobacter sakazakii |
1891 |
99.7% |
/ |
|
10 |
腦膜炎球菌 |
Elizabethkingia meningoseptica |
93 |
100.0% |
/ |
|
11 |
陰溝腸桿菌 |
Enterobacter cloacae |
753 |
97.2% |
/ |
|
12 |
日溝維腸桿菌 |
Enterobacter gergoviae |
79 |
100.0% |
/ |
|
13 |
產(chǎn)硫球鏈菌 |
Globicatella sulfidifaciens |
6 |
100.0% |
/ |
|
14 |
產(chǎn)氣克雷伯菌 |
Klebsiella aerogenes |
1592 |
99.6% |
/ |
|
15 |
產(chǎn)酸克雷伯菌 |
Klebsiella oxtoca |
947 |
99.1% |
/ |
|
16 |
肺炎克雷伯菌 |
Klebsiella pnenmoniae |
7582 |
100.0% |
/ |
|
17 |
軍團(tuán)菌屬 |
Legionella spp. |
5993 |
95.5% |
/ |
|
18 |
李斯特菌屬 |
Listeria spp. |
5689 |
97.4% |
/ |
|
19 |
莫拉氏菌 |
Moraxella spp. |
438 |
54.1% |
3靶點(diǎn),可達(dá)82.8% |
|
20 |
雷氏普羅威登菌 |
Providencia rettgeri |
363 |
99.2% |
/ |
|
21 |
銅綠假單胞菌 |
Pseudomonas aeruginosa |
9366 |
99.4% |
/ |
|
22 |
熒光假單胞菌 |
Pseudomonas fluorescens |
204 |
97.5% |
/ |
|
23 |
淺黃假單胞菌 |
Pseudomonas luteola |
11 |
100.0% |
/ |
|
24 |
惡臭假單胞菌 |
Pseudomonas putida |
386 |
94.8% |
/ |
|
25 |
多刺假單胞菌 |
Pseudomonas spinosa |
4 |
100.0% |
/ |
|
26 |
解甘露醇羅爾斯頓菌 |
Ralstonia mannitolilytica |
28 |
100.0% |
/ |
|
27 |
皮氏羅爾斯頓菌 |
Ralstonia pickettii |
94 |
91.5% |
2靶基因,98.9% |
|
28 |
液化沙雷菌 |
Serratia liquefaciens |
118 |
98.3% |
2靶基因,99.15% |
|
29 |
粘質(zhì)沙雷氏菌 |
Serratia marcescens |
2499 |
99.5% |
/ |
|
30 |
鞘氨醇假單胞菌 |
Sphingomonas paucimobilis |
18 |
100.0% |
/ |
|
31 |
金黃色葡萄球菌 |
Staphylococcus aureus |
8460 |
100.0% |
/ |
|
32 |
中間葡萄球菌 |
Staphylococcus intermedius |
8 |
100.0% |
/ |
|
33 |
腐生葡萄球菌 |
Staphylococcus saprophyticus |
483 |
100.0% |
/ |
|
34 |
沃氏葡萄球菌 |
Staphylococcus warneri |
183 |
100.0% |
/ |
|
35 |
嗜麥芽黃桿菌 |
Stenotrophomonas maltophila |
1594 |
97.8% |
/ |
*上述覆蓋率涉及的靶基因,已排除過非目標(biāo)菌的非特異性擴(kuò)增。
1 全面詳實(shí)的評估報(bào)告
菌種內(nèi)全部已知菌株的覆蓋率百分比:全面分析特定菌種下GeneBank中已知菌株全基因組序列,鎖定高覆蓋率基因,確保對目標(biāo)菌種內(nèi)全部菌株的高覆蓋率。
對所有非目標(biāo)微生物的非特異性檢出評估結(jié)果:調(diào)取GeneBank中全部已知非目標(biāo)微生物序列,評估候選探針、引物的非特異性反應(yīng),篩選出具有高特異性的探針和引物。
2 卓越檢測性能與便捷操作
高靈敏度:檢測限低至20拷貝/反應(yīng)(qPCR)或單拷貝(dPCR),檢測低含量目標(biāo)微生物。
多重檢測:探針法qPCR支持多重qPCR/dPCR檢測,支持同一反應(yīng)體系內(nèi)同時(shí)檢測2-4種菌種,大大提高實(shí)驗(yàn)效率,節(jié)省時(shí)間與成本。
即用型預(yù)混配方:含DNA聚合酶、dNTP、UNG酶等成分,簡化實(shí)驗(yàn)流程,減少誤差。
dUTP/UNG防污染系統(tǒng):降低PCR產(chǎn)物氣溶膠污染,極大程度上防止假陽性結(jié)果的出現(xiàn)。
提供陽性/陰性對照(1×107拷貝/μL):有效區(qū)分假陰性與假陽性,保障結(jié)果可信度。
3 全流程方法學(xué)驗(yàn)證
通過qPCR條件優(yōu)化、線性范圍、靈敏度、抗干擾性等全流程驗(yàn)證,qPCR定量線性范圍達(dá)5個(gè)數(shù)量級,確保試劑盒性能卓越可靠。
使用格微@菌種特異性qPCR探針試劑盒對樣本進(jìn)行檢測,以2*106copies-2*101copies/反應(yīng)的質(zhì)粒為模板展示了不同熒光信號(FAM、HEX、ROX、CY5)在TE背景和人基因組DNA背景下的檢測結(jié)果,具體如下:
總體擴(kuò)增情況:從總體擴(kuò)增圖來看,各熒光信號對應(yīng)的曲線呈現(xiàn)明顯的S型擴(kuò)增曲線,表明在反應(yīng)體系中模板DNA得到了有效的擴(kuò)增。試劑盒具有較好的穩(wěn)定性和可靠性。
不同背景下CT值:在TE背景和人的基因組DNA背景下,針對A、B、C、D菌,四種熒光信號的標(biāo)準(zhǔn)曲線均呈現(xiàn)良好線性,擴(kuò)增效率在90%-110%之間,線性關(guān)系在0.999。試劑盒在復(fù)雜背景中可特異性檢測目標(biāo)微生物DNA,具有高準(zhǔn)確性、特異性和抗干擾能力。
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