菌種/屬特異性TaqMan探針/引物設(shè)計(jì)

高特異性、高靈敏度、全流程服務(wù)，助力微生物組學(xué)研究

在微生物組學(xué)研究中，準(zhǔn)確檢測和定量分析目標(biāo)菌屬或菌種是揭示微生物群落功能機(jī)制的關(guān)鍵。微基生物依托先進(jìn)的生物信息學(xué)技術(shù)和豐富的實(shí)驗(yàn)經(jīng)驗(yàn)，提供基于全基因組序列的菌種/屬特異性TaqMan探針/引物設(shè)計(jì)、合成及驗(yàn)證服務(wù)。從而實(shí)現(xiàn)在復(fù)雜的微生物群落背景下實(shí)現(xiàn)單菌種級(jí)別的絕對定量。

服務(wù)亮點(diǎn) 

1.高特異性與靈敏度

全基因組比對和優(yōu)化設(shè)計(jì)，確保探針/引物僅與目標(biāo)序列高度匹配，避免非特異性擴(kuò)增。

2.靈活的檢測方法

提供qPCR探針法和液滴數(shù)字PCR（ddPCR）等檢測方法，滿足不同樣本類型和研究需求。

3.全流程服務(wù)

數(shù)據(jù)庫構(gòu)建到探針/引物設(shè)計(jì)、驗(yàn)證與優(yōu)化，再到大規(guī)模檢測，一站式解決實(shí)驗(yàn)需求。

4.可靠的數(shù)據(jù)支持

嚴(yán)格的質(zhì)量控制和優(yōu)化流程，確保實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性和可重復(fù)性。

服務(wù)流程 

1.數(shù)據(jù)庫構(gòu)建

查詢菌種/屬的序列信息，構(gòu)建全基因組數(shù)據(jù)庫。

2.引物/探針設(shè)計(jì)

利用生物信息學(xué)工具，設(shè)計(jì)特異性引物或探針。

3.驗(yàn)證與優(yōu)化

合成設(shè)計(jì)好的引物或探針，并進(jìn)行特異性、擴(kuò)增效率等驗(yàn)證和優(yōu)化。

4.大規(guī)模檢測

使用驗(yàn)證通過的引物或探針對目標(biāo)菌種/屬進(jìn)行大規(guī)模檢測。

qPCR TaqMan探針檢測方法 

微基生物提供基于TaqMan探針的qPCR探針/引物設(shè)計(jì)服務(wù)。確保探針與目標(biāo)序列特異性結(jié)合，通過Taq酶水解探針產(chǎn)生可檢測的熒光信號(hào)。優(yōu)化Tm值和長度，提高擴(kuò)增效率和特異性。                           

 

qPCR TaqMan探針法

液滴數(shù)字PCR（ddPCR）法

微基生物提供基于液滴數(shù)字PCR（ddPCR）的探針/引物設(shè)計(jì)服務(wù)。無需標(biāo)準(zhǔn)曲線，直接對目標(biāo)菌種進(jìn)行絕對定量分析。特別適用于臨床樣本、環(huán)境樣本及低豐度菌種的檢測。

客戶提供信息 

目標(biāo)菌種/屬的拉丁文全名。

目標(biāo)菌種的全基因組序列或靶標(biāo)基因序列。

案例分享 

Detecting and quantifying Veillonella by real-time quantitative PCR and droplet digital PCR.（2024年）

針對維洛內(nèi)拉菌（Veillonella）低豐度樣本的檢測需求，設(shè)計(jì)特異性引物和探針，評(píng)估qPCR和ddPCR方法的特異性和敏感性。

研究方法

1.基于16S rRNA基因序列設(shè)計(jì)引物和探針，進(jìn)行qPCR和ddPCR檢測。

2.使用模擬臨床樣本測試兩種方法的特異性和靈敏度。

3.收集炎癥性腸?。↖BD）患者的臨床樣本，驗(yàn)證檢測系統(tǒng)的有效性。

研究結(jié)果

1.qPCR的檢測靈敏度100拷貝/μL，能夠準(zhǔn)確檢測10³到10⁸CFU/mL的Veillonella濃度。

2.ddPCR的檢測靈敏度為11.3拷貝/μL，適合檢測10¹到10⁴CFU/mL的低豐度樣本。

3.臨床樣本中，qPCR和ddPCR的檢測結(jié)果與平板計(jì)數(shù)法一致，驗(yàn)證了檢測系統(tǒng)的準(zhǔn)確性。

4.通過ddPCR檢測到的Veillonella種類包括V.dispar、V.nakazawae和V.rodentium。      

qPCR檢測的靈敏度和特異性結(jié)果 

             

 ddPCR檢測的靈敏度和特異性結(jié)果

qPCR和ddPCR均適用于檢測和定量維洛內(nèi)拉菌，其中qPCR更適合檢測較高豐度的樣本，而ddPCR更適合檢測低豐度的樣本。

 

微基生物致力于為微生物研究提供全面、高效的解決方案。選擇菌種/屬特異性TaqMan探針/引物設(shè)計(jì)與檢測服務(wù)，讓您的實(shí)驗(yàn)更高效、更可靠！