菌種鑒定

微基生物專注微生物多樣性研究，為高校、醫(yī)院、研究所等單位提供科研服務(wù)。不僅可以檢測(cè)土壤、水體、糞便、腸道內(nèi)容物等樣本中混合微生物的種類及豐度，而且還可以提供細(xì)菌、真菌等純菌的菌種鑒定服務(wù)。
土壤、水體、糞便等樣本中的微生物一般為混合菌，需要在一定條件下通過培養(yǎng)、分離、純化后，得到純菌。對(duì)純的細(xì)菌、真菌等菌種，均可進(jìn)行菌種鑒定服務(wù)。
菌種鑒定一般是提取純菌A的基因組DNA，然后PCR擴(kuò)增16s rDNA片段，之后通過一代測(cè)序或三代測(cè)序檢測(cè)16S rDNA的全長(zhǎng)，與國(guó)際上的數(shù)據(jù)庫進(jìn)行Blast比對(duì)，默認(rèn)選取比對(duì)結(jié)果中相似性最高的前10位的物種分類信息，之后構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹，最后得出樣本A與XX物種的相似性最高。

技術(shù)路線：

部分結(jié)果展示：

Blast比對(duì)結(jié)果

比對(duì)結(jié)果物種分類信息注釋

系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建