ITS序列是內(nèi)源轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)（Internally Transcribed Spacer），位于真菌18S、5.8S和28S rRNA基因之間，分別為ITS 1和ITS 2。 在真菌中，5.8S、18S和28S rRNA基因具有較高的保守性，而ITS由于承受較小的自然選擇壓力，在進化過程中能夠容忍更多的變異，在絕大多數(shù)真核生物中表現(xiàn)出極為廣泛的序列多態(tài)性。同時，ITS的保守型表現(xiàn)為種內(nèi)相對一致，種間差異較明顯，能夠反映出種屬間，甚至菌株間的差異。并且ITS序列片段較?。↖TS 1和ITS 2長度分別為350 bp和400 bp），易于分析，目前已被廣泛用于真菌不同種屬的系統(tǒng)發(fā)育分析。 微基生物進行人體健康相關(guān)的研究與應用：

微基生物提供與人體健康相關(guān)的生信/統(tǒng)計服務： 更多微生態(tài)方向研究和生物信息方面服務，請詳詢：400-660-9270 真菌多樣性分析流程如下：

• 高通量測序
  

目前市面上常用的用于研究環(huán)境微生物的高通量測序平臺有Illumina MiSeq，Roche 454和Ion Torrent PGM。針對于真菌ITS序列，MiSeq憑借其測序讀長長、測序周期短、通量大等特點，成為使用最為普遍的測序平臺。 微基生物是國內(nèi)首家采用Illumina-MiSeq 2×300 bp平臺進行微生物生態(tài)研究，其最大讀長可達到550 bp，能夠很好地覆蓋ITS 1和ITS 2序列，對其進行測序分析。

• 生物信息/統(tǒng)計分析
  

案例分析

標題：Integrated Meta-omics Approaches To Understand the Microbiome of Spontaneous Fermentation of Traditional Chinese Pu-erh TeamSystems (IF: 6.633) 

研究領(lǐng)域：食品

分析物種：細菌，真菌

高通量測序平臺：Illumina MiSeq

測序區(qū)域：V4V5，ITS 1

主要結(jié)果：

原文鏈接：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6867877/

參考文獻：Zhao M, Su XQ, Nian B, et al. Integrated Meta-omics Approaches To Understand the Microbiome of Spontaneous Fermentation of Traditional Chinese Pu-erh Tea. mSystems. 2019;4(6):e00680-19. Published 2019 Nov 19. doi:10.1128/mSystems.00680-19