1 基本概念

2 血液微生物組樣本采集方法與注意事項(xiàng)
2.1全血取樣:研究血液微生物多樣性的首選
全血樣本可完整保留血漿、紅細(xì)胞、白細(xì)胞等各組分中的微生物及其遺傳物質(zhì),是全面分析血液微生物群落的核心選擇。經(jīng)優(yōu)化檢測(cè)流程處理后,微生物檢出效率與紅細(xì)胞層/血細(xì)胞層樣本一致性達(dá)98%以上,且無(wú)需額外離心分層,操作簡(jiǎn)單,污染風(fēng)險(xiǎn)低。
2.1.1全血樣本采樣步驟
采樣前準(zhǔn)備:選擇符合實(shí)驗(yàn)條件的受試者,告知實(shí)驗(yàn)相關(guān)信息并簽署知情同意書;準(zhǔn)備EDTA或肝素抗凝采血管、一次性采血針、無(wú)菌注射器、冰浴設(shè)備等,確保所有耗材無(wú)菌。
采集操作:采集2-5mL外周血于抗凝采血管中或進(jìn)口離心管中(提前添加抗凝劑)。輕輕顛倒搖晃混勻(不可劇烈搖晃,以防溶血)。
2.2血液中不同組分的取樣:針對(duì)性研究特定微生物群落
若需聚焦特定血液組分中的微生物,可采集全血后在實(shí)驗(yàn)室規(guī)范離心分層,再選取目標(biāo)組分檢測(cè)。建議先采集全血,再進(jìn)行離心處理,既滿足分層樣本需求,又可保留全血樣本以備復(fù)檢或其他檢測(cè)。
血漿:微生物含量極低(僅占0.03%),聚焦細(xì)胞游離微生物DNA(cfmDNA),適用于感染早期診斷、疾病相關(guān)微生物標(biāo)志物篩選等研究。
Buffy 層(白細(xì)胞層):微生物DNA含量最豐富,適用于高靈敏度微生物DNA檢測(cè),尤其適合研究胞內(nèi)寄生微生物及極低豐度的微生物。
紅細(xì)胞層:含少量微生物DNA,適合分析紅細(xì)胞內(nèi)寄生微生物,避免溶血影響核酸提取效率。
2.2.1分層樣本采樣步驟
采樣前準(zhǔn)備:與全血采樣一致,需額外準(zhǔn)備低溫離心機(jī)、無(wú)菌離心管等設(shè)備。
全血采集:采集2-5mL外周血于抗凝采血管中或進(jìn)口離心管中(提前添加抗凝劑),輕輕顛倒搖晃混勻(不可劇烈搖晃,以防溶血),4℃或冰浴靜置約10min,先低溫低速離心(3000rpm,10min,4℃),使血液分為血漿層(上層)、白細(xì)胞和血小板層(中層)、紅細(xì)胞層(下層)。用無(wú)菌移液器或吸管分別吸取目標(biāo)組分。
2.3注意事項(xiàng)
a)不要使用無(wú)抗凝劑的采血管(凝血后,微生物基因組提取變得非常困難)。
b)采血過(guò)程需等消毒劑(乙醇、異丙醇等)完全揮發(fā)后采樣。
c)采集過(guò)程中,樣品放置時(shí)間,離心時(shí)間、等保持一致。
d)紅細(xì)胞/血細(xì)胞層得率約50%,1mL外周血可得約0.5mL血細(xì)胞層。
e) 樣本按500μL/支分裝,方便后繼需要多次檢測(cè),盡量避免樣本多次凍融。
f)血細(xì)胞層如發(fā)生溶血(凍存前或凍存后),只要不凝塊,不影響微生物基因組DNA提取。
3 血液代謝組樣本采集方法與注意事項(xiàng)
3.1 血漿樣本代謝組檢測(cè)
3.1.1 采集步驟
采集2-5mL外周血于抗凝采血管中或進(jìn)口離心管中(需提前添抗凝劑),輕輕顛倒搖晃混勻(不可劇烈搖晃,以防溶血),4℃或冰浴靜置約10min,先低溫低速離心(3000rpm, 10min,4℃),取大部分上層血漿,200μL分裝到潔凈螺口管中,液氮速凍15min(可省略)。
3.1.2注意事項(xiàng)
a) LC-MS平臺(tái)推薦使用肝素鈉/EDTA 抗凝,NMR平臺(tái)推薦使用肝素鈉抗凝;血漿樣品不推薦使用檸檬酸做抗凝劑,因?yàn)闄幟仕崾?/span>TCA循環(huán)中的重要物質(zhì),使用檸檬酸鈉抗凝劑會(huì)引入外源污染。而EDTA會(huì)影響NMR采譜。需注意肝素鈉會(huì)對(duì)RNA相關(guān)的實(shí)驗(yàn)有負(fù)面作用,主要是因?yàn)闀?huì)抑制反轉(zhuǎn)錄酶活性。請(qǐng)根據(jù)實(shí)驗(yàn)需求選擇合適抗凝管。
b)采血過(guò)程需等消毒劑(乙醇、異丙醇等)完全揮發(fā)后采樣。
c)采集過(guò)程中,樣品放置時(shí)間,離心時(shí)間等保持一致。
d)分裝使用的離心管盡可能使用低吸附離心管。
e)血漿得率約50%,1mL外周血可得約0.5mL血漿。
f) 樣本按200μL/支分裝,是方便后繼需要多次檢測(cè),應(yīng)盡量避免樣本多次凍融情況。
3.2血清樣本代謝組檢測(cè)
3.2.1 采集步驟
采集2-5mL外周血于無(wú)任何添加劑的采血管或進(jìn)口離心管中,輕輕顛倒搖晃混勻(不可劇烈搖晃,以防溶血),4℃或冰浴靜置約1h(確認(rèn)凝集出血塊),先低溫低速離心(3000rpm,10min,4℃);取大部分上層血清,將上述血清按200μL/支,分裝至螺口管中,液氮速凍15min(可省略)。如血清量不夠,可再次高速離心(12000rpm,10min,4℃),取剩余少量上層血清,如發(fā)生溶血,則不可再取/用。
3.2.2 注意事項(xiàng)
a)血清樣品推薦使用無(wú)采任何添加劑的采血管(不用有促凝劑的采血管)。
b)采血過(guò)程需等消毒劑(乙醇、異丙醇等)完全揮發(fā)后采樣。
c)采集過(guò)程中,樣品放置時(shí)間,離心時(shí)間等保持一致。
d)血清得率約30-50%,1mL外周血可得約0.3-0.5mL血清。
e) 樣本按200μL/支分裝,是方便后繼需要多次檢測(cè),應(yīng)盡量避免樣本多次凍融情況。
4 推薦采樣量
|
檢測(cè)類型 |
血液成分 |
推薦采集用量 |
備注 |
|
微生物組 |
全血 |
2-5mL |
添加EDTA或肝素抗凝劑 |
|
buffy層 (白細(xì)胞、血小板) |
500μL*2支 |
由2-5mL全血離心分層獲得,添加抗凝劑 |
|
|
代謝組 |
血漿 |
200μL*3支 |
添加EDTA抗凝劑,離心后立即分裝冷凍 |
|
血清 |
200μL*3支 |
無(wú)抗凝劑,自然凝固后離心,避免反復(fù)凍融 |
5 樣本的保存和寄送
短期保存(≤24小時(shí)):采集后立即置于4℃冷藏保存,避免室溫放置超過(guò)4小時(shí)。分層樣本需單獨(dú)密封保存,防止交叉污染,尤其血漿樣本需避免與細(xì)胞組分接觸導(dǎo)致游離DNA降解。
長(zhǎng)期保存(>24 小時(shí)):樣本按對(duì)應(yīng)分裝標(biāo)準(zhǔn)分裝入潔凈螺口管,避免反復(fù)凍融。-80℃冰箱可保存6-12個(gè)月,-20℃冰箱可短期保存1-3個(gè)月。
特殊注意事項(xiàng):
需保留微生物活性或進(jìn)行微生物培養(yǎng)的樣本,必須使用抗凝劑防止凝固,存放于室溫或4℃冰箱,且需盡快開(kāi)展后續(xù)實(shí)驗(yàn),不宜長(zhǎng)期存放。
冷凍后的全血樣本解凍后,輕微溶血可正常檢測(cè);嚴(yán)重溶血(血液呈醬油色)需重新采集,避免血紅蛋白干擾核酸提取。
若無(wú)法實(shí)現(xiàn)低溫保存,可使用微基生物研發(fā)的微生物DNA常溫采集保存套裝,樣本可在常溫下穩(wěn)定保存14天。
6 附(抗凝管的種類和顏色)
提示:血液樣本的代謝組學(xué)檢測(cè),采血管只接收紅蓋(無(wú)添加),綠蓋(添加肝素鈉),紫蓋(添加EDTA)。禁用PAXgene管,添加促凝劑的紅蓋管等。
7 常見(jiàn)問(wèn)題解答
1)全血樣本與分層樣本的檢測(cè)結(jié)果有差異嗎?
無(wú)顯著差異,全血樣本經(jīng)優(yōu)化檢測(cè)流程后,微生物檢出效率與紅細(xì)胞層/血細(xì)胞層樣本一致性達(dá)98%以上,不影響檢測(cè)準(zhǔn)確性。
2)忘記加抗凝劑的全血樣本還能檢測(cè)嗎?
不可檢測(cè)。未抗凝的血液會(huì)發(fā)生凝固,導(dǎo)致細(xì)胞裂解和微生物失活,嚴(yán)重影響檢測(cè)結(jié)果。
3)全血樣本可以檢測(cè)哪些微生物?
適用于檢測(cè)細(xì)菌、真菌、病毒、非典型病原體等多種微生物。全血mNGS技術(shù)可以同時(shí)檢測(cè)數(shù)千種微生物,提高了檢測(cè)的全面性。
4)采血量對(duì)檢測(cè)結(jié)果有影響嗎?
有影響,采血量直接影響檢測(cè)的靈敏度。推薦按標(biāo)準(zhǔn)采血量采集,采血量不足會(huì)降低微生物檢出率。
5)可以使用不同類型的抗凝劑嗎?
推薦使用EDTA抗凝劑;肝素抗凝劑也可使用,但需注意其可能抑制某些PCR反應(yīng);不推薦使用枸櫞酸鈉抗凝劑。
6)可以檢測(cè)到所有病原體嗎?
目前沒(méi)有任何一種方法可以檢測(cè)到所有病原體。不同檢測(cè)方法各有優(yōu)劣,微基生物可根據(jù)您的臨床需求選擇合適方法,必要時(shí)聯(lián)合多種方法提高檢出率。

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