生物膜

　　生物膜離子通道（Ion channels of biomembrane）是各種無(wú)機(jī)離子跨膜被動(dòng)運(yùn)輸?shù)穆?。生物膜?duì)無(wú)機(jī)離子的跨膜運(yùn)輸有被動(dòng)運(yùn)輸（順離子濃度梯度）和主動(dòng)運(yùn)輸（逆離子濃度梯度）兩種方式。被動(dòng)運(yùn)輸?shù)耐贩Q(chēng)離子通道，主動(dòng)運(yùn)輸?shù)碾x子載體稱(chēng)為離子泵。生物膜對(duì)離子的通透性與多種生命活動(dòng)過(guò)程密切相關(guān)。例如，感受器電位的發(fā)生，神經(jīng)興奮與傳導(dǎo)和中樞神經(jīng)系統(tǒng)的調(diào)控功能，心臟搏動(dòng)，平滑肌蠕動(dòng)，骨骼肌收縮，激素分泌，光合作用和氧化磷酸化過(guò)程中跨膜質(zhì)子梯度的形成等?；铙w細(xì)胞不停地進(jìn)行新陳代謝活動(dòng)，就必須不斷地與周?chē)h(huán)境進(jìn)行物質(zhì)交換，而細(xì)胞膜上的離子通道就是這種物質(zhì)交換的重要途徑，人們已經(jīng)知道，大多數(shù)對(duì)生命具有重要意義的物質(zhì)都是水溶性的，如各種離子，糖類(lèi)等，它們需要進(jìn)入細(xì)胞，而生命活動(dòng)中產(chǎn)生的水溶性廢物也要離開(kāi)細(xì)胞，它們出入的通道就是細(xì)胞膜上的離子通道。

　　離子通道由細(xì)胞產(chǎn)生的特殊蛋白質(zhì)構(gòu)成，它們聚集起來(lái)并鑲嵌在細(xì)胞膜上，中間形成水分子占據(jù)的孔隙，這些孔隙就是水溶性物質(zhì)快速進(jìn)出細(xì)胞的通道.離子通道的活性，就是細(xì)胞通過(guò)離子通道的開(kāi)放和關(guān)閉調(diào)節(jié)相應(yīng)物質(zhì)進(jìn)出細(xì)胞速度的能力，對(duì)實(shí)現(xiàn)細(xì)胞各種功能具有重要意義。

• 高通量分析流程

• 樣品采集及運(yùn)送

　　新鮮樣品：水膜提取物3-5 g

　　DNA樣品：濃度大于 10ng/μL，總量大于 500ng 的基因組 DNA，DNA 純度較差或降解嚴(yán)重會(huì)影響后繼的擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)。如果方便的話(huà)，可提供電子版DNA電泳檢測(cè)照片及 OD260/280=1.8-2.0比值

　　樣品運(yùn)送：送樣時(shí)采用干冰保存運(yùn)輸；若是距離較遠(yuǎn)，建議采用干冰加冰袋，存放于冰盒中運(yùn)送

• 生信/統(tǒng)計(jì)分析

 

案例分析

標(biāo)題：消毒對(duì)飲用水生物膜細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的影響

高通量測(cè)序平臺(tái)：Illumina MiSeq

主要實(shí)驗(yàn)結(jié)果

　　1.在飲用水生物膜樣品中細(xì)菌相對(duì)豐度

　　

2.氯含量與厚壁菌門(mén)和變形菌門(mén)的線性關(guān)系

　　

3.飲用水生物膜中變形菌門(mén)的細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)

　　

4.飲用水生物膜中細(xì)菌中相對(duì)豐度

?原文鏈接：http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1001074215002375

參考文獻(xiàn)：

Mi, Z., Y. Dai, S. Xie, C. Chen and X. Zhang (2015). “Impact of disinfection on drinking water biofilm bacterial community.” Journal of Environmental Sciences.