引物設(shè)計(jì)&驗(yàn)證

針對(duì)日益研究火熱的微生物，微基生物新推出qPCR引物設(shè)計(jì)及驗(yàn)證，可以提供細(xì)菌菌株、菌種、菌屬特異性qPCR檢測(cè)引物設(shè)計(jì)及驗(yàn)證。

客戶提供信息

對(duì)于菌株特異性qPCR引物設(shè)計(jì)服務(wù)，客戶需提供該菌株拉丁文全名或該菌株的測(cè)序結(jié)果（建議提供全序列而非16S全長(zhǎng)序列）。

對(duì)于菌屬特異性qPCR引物設(shè)計(jì)服務(wù)，客戶需提供屬的拉丁文全名。

服務(wù)流程

      

 1 通過查詢菌株或菌屬的序列信息，構(gòu)建目的菌群全基因組數(shù)據(jù)庫；

 2 設(shè)計(jì)特異性引物

 3 特異性引物合成、驗(yàn)證及優(yōu)化

 4 菌株/菌屬特異性qPCR大規(guī)模檢測(cè)  

 

 代表性案例

產(chǎn)假單胞菌菌株ATCC 25775引物設(shè)計(jì)驗(yàn)證

該菌株目前沒有文獻(xiàn)發(fā)表相關(guān)引物，我們從NCBI下載了該菌的全基因組（該菌株的GC含量在30%左右），構(gòu)建該菌株的數(shù)據(jù)庫，之后通過生物信息學(xué)方法來設(shè)計(jì)引物（有SYBRGREEN法和探針法）。合成質(zhì)粒后，對(duì)設(shè)計(jì)的質(zhì)粒進(jìn)行擴(kuò)增效率的測(cè)試，最終的擴(kuò)增效率(E值）在TE空白體系DNA背景擴(kuò)增體系內(nèi)，分別達(dá)到98.8%和100%。

探針法：

        

SYBR GREEN法：

溶解曲線：