關(guān)于微基生物

　　微基生物致力于協(xié)助科研人員探索微生態(tài)與健康、生產(chǎn)、環(huán)境之間隱藏的奧秘，更好地利用微生物資源。
　　同時開展Illumina?Miseq、　Ion PGM及Roche 454二代高通量測序分析，PacBio第三代高通量測序分析，PCR-DGGE變性梯度凝膠分析，克隆文庫等多種微生態(tài)分析方法的公司。公司擁有經(jīng)驗豐富的技術(shù)團隊，涉及分子生物學(xué)、醫(yī)學(xué)、生物信息學(xué)、統(tǒng)計生態(tài)學(xué)方面，核心成員具有10余年一線科研工作經(jīng)驗。
　　微基生物已完成300余項微生物多樣性分析項目，分析樣本6000余例。研究對象涉及糞菌、土壤、水體、發(fā)酵物、腸道、人體微生物等各類樣本。
　　微基生物將繼續(xù)專注微生態(tài)研究，緊跟國際分子生物學(xué)技術(shù)、生物信息學(xué)、統(tǒng)計分析技術(shù)發(fā)展，以更好的服務(wù)質(zhì)量，協(xié)助研究者解碼微生物世界的奧秘！

分析案例

案例分析案例：某類細菌在相關(guān)疾病爆發(fā)過程中與其他細菌/真菌的相關(guān)性。

　　分析方法：相關(guān)性分析是用于分析微生物間相互作用關(guān)系的經(jīng)典方法，可甄別出微生 物群落間（包括細菌、真菌、古細菌等各類檢測目標）具有顯著相關(guān)性、強相關(guān)、正相關(guān)、負相關(guān)的各項。

分析案例：? 丁酸鹽產(chǎn)生菌的減少和一些致病微生物的增加使得CRC患者腸道微生物菌落的失衡

　　Tingting Wang等采用高通量測序技術(shù)研究結(jié)直腸癌（CRC）患者與正常人群腸道微生物的菌落組成差異。并結(jié)合real-time PCR對相關(guān)基因進行分析，最終確定丁酸鹽產(chǎn)生菌的減少和一些致病微生物的增加使得CRC患者腸道微生物菌落的失衡。實驗對象的數(shù)目：CRC患者46人，健康志愿者56人。

Structural segregation of gut microbiota between colorectal cancer patients and healthy volunteers. 2012.? The ISME Journal

分析案例：服用某中草藥改變腸道菌群，進而緩解二型糖尿病

　　腸道菌群對新陳代謝疾?。ㄈ缍吞悄虿2D）有重要的作用，傳統(tǒng)的中草藥葛根芩連湯（GQD）對二型糖尿病有緩和作用。
　　為了研究GQD對T2D的調(diào)節(jié)作用是否通過改變腸道菌群的組成，Jia Xu等對187名T2D患者給予不同劑量的GQD（44名給予高劑量，52名給予中劑量，50名給予低劑量，41名給予安慰劑），對腸道微生物進行研究。高劑量和中劑量處理的樣本較低劑量和安慰劑處理的樣本中空腹血糖（FBG）和糖化的血紅蛋白（HbA1c）顯著降低，通過RDA分析，鑒定出47個豐富的種，其中17個與FBG負相關(guān)，9個與HbA1c負相關(guān)。
實驗結(jié)果顯示，中草藥GOD處理可以增加有益微生物的種類，如Faecalibacterium spp。

Structural modulation of gut microbiota during alleviation of type 2 diabetes with a Chinese herbal formula. 2015. The ISME Journal

相關(guān)分析方法：采用網(wǎng)絡(luò)分布圖展示不同個體或人群的腸道微生物分布，可以形象的展示不同個體或人群之間的相同物種或是OTU的相似、分布情況。

相關(guān)分析方法： 利用冗余分析（RDA）反映在某微生物分類級別上（如屬）不同個體腸道菌群差異與健康、藥物、飲食之間關(guān)系。

專業(yè)微生態(tài)、微生物多樣性分析服務(wù)_微基生物，首發(fā)于微基生物。

　　重金屬在人體中累積達到一定程度，會造成慢性中毒。重金屬污染土壤的生態(tài)修復(fù)主要是利用植物或土壤中天然的微生物資源，削減、凈化土壤中重金屬或降低重金屬毒性，從而使污染物的濃度降低到可接受的水平，或?qū)⒂卸居泻Φ奈廴疚镛D(zhuǎn)化為無害的物質(zhì)，也包括將污染物穩(wěn)定化，以減少其向周邊環(huán)境的擴散。重金屬的植物修復(fù)，就是利用植物在水或土壤中固定、降解或提取污染物。重金屬污染的特點是不能被微生物降解而從環(huán)境中徹底消除，只能從一種形態(tài)轉(zhuǎn)化為另一種形態(tài)。

　　所以重金屬的微生物修復(fù)通過以下途徑：利用微生物化學(xué)、微生物有效性和微生物活性原則，把重金屬轉(zhuǎn)化為較低毒性產(chǎn)物（絡(luò)合態(tài)、脫烷基、改變價態(tài)）；或利用重金屬與微生物的親和性進行吸附及生物學(xué)活性最佳的機會，降低重金屬的毒性和遷移能力。

　　植物提取修復(fù)是植物修復(fù)中的一種，即通過植物吸收和轉(zhuǎn)運的方式，轉(zhuǎn)移污染土壤中的污染物進入植物的可收獲部分，這相當于是一種對金屬的濃縮技術(shù)。盡管植物修復(fù)雖然克服了微生物修復(fù)難以收集的缺點，但過量的重金屬往往對植物生長產(chǎn)生抑制，且修復(fù)植物的生物量太小，修復(fù)過程緩慢。因而將二者結(jié)合起來利用微生物強化重金屬植物修復(fù)，可使生物修復(fù)效果的有效性得以提高。

在重金屬污染土壤的生態(tài)修復(fù)過程中微生物主要通過以下幾種方式起作用：

　　1.通過微生物的吸附、代謝達到對重金屬消減、凈化作用和固定作用；
　　2.通過微生物改變重金屬的化學(xué)形態(tài)，使重金屬固定或生物可利用性降低，減少重金屬的危害；
　　3.土壤微生物過氧化還原作用改變根際重金屬形態(tài)或產(chǎn)生的有機酸等方式可能增加金屬的溶解性，提高重金屬的有效性，以利于植物吸收；
　　4.通過促進植物作物生長、提高植物抗病、抗逆能力等方式間接影響修復(fù)效率。

重金屬污染，首發(fā)于微基生物。

? ? ? ?宏基因組學(xué)以微生物的多樣性、種群的結(jié)構(gòu)、進化關(guān)系、功能活性、相互間的協(xié)作關(guān)系以及與環(huán)境之間的關(guān)系為研究目的，其研究方法有功能基因篩選及測序分析。運用的技術(shù)手段包括環(huán)境基因組整體測序及特征基因的擴增子序列。

優(yōu)點：

? ? ? ? ? ? 宏基因組不依賴于微生物的分離培養(yǎng)，克服了傳統(tǒng)的純培養(yǎng)方法的技術(shù)限制，為研究和開發(fā)利用占微生物種類99%以上的未可培養(yǎng)的微生物提供了一種新的途徑和良好的策略；

? ? ? ? ? 可以得到環(huán)境中豐度較低的，甚至是痕量微生物的信息，為研究低豐度微生物提供了途徑；

? ? ? ? ?宏基因組學(xué)引入了宏觀生態(tài)的研究理念，對環(huán)境中微生物菌群的多樣性、功能活性等宏觀特征進行研究，可以更準確地反應(yīng)出微生物生存的真實狀態(tài)。

微基生物進行人體健康相關(guān)的研究與應(yīng)用：

微基生物提供與人體健康相關(guān)的生信/統(tǒng)計服務(wù)：

更多微生態(tài)方向研究和生物信息方面服務(wù)，請詳詢：400-660-9270

高通量分析流程：

微生物多樣性及宏基因組分析，首發(fā)于微基生物。