人體微生態(tài)(宏基因組)與健康的整體研究方案_微基生物,首發(fā)于微基生物。
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微基生物是專注于從事微生態(tài)研究的公司,具有Illumina MiSeq、Ion PGM等高通量測序分析,以及PCR-DGGE、Real-Time PCR等多種微生態(tài)分析平臺。微基生物提供整套微生態(tài)研究方案:涵蓋實(shí)驗(yàn)設(shè)計、樣本采集、保存、預(yù)實(shí)驗(yàn)與改進(jìn)、數(shù)據(jù)分析與解析。 專業(yè)、用心,微基生物努力做得更好!
腸道菌群與健康整體研究方案:
微基生物提供整體研究方案:研究健康人群與病患腸道菌群差異、藥物/飲食干預(yù)前后區(qū)別、營養(yǎng)成分及藥物濃度對腸道菌群的影響…
皮膚微生態(tài)與健康整體研究方案:
微基生物針對皮膚微生物數(shù)量相對較少的特點(diǎn),優(yōu)化實(shí)驗(yàn)方法,增加對痕量微生物的檢出率,為您研究正常、疾病狀態(tài)下皮膚微生物數(shù)量、種類及差異等,提供全面、整體的研究方案。
口腔微生物整體研究方案:
針對口腔微生物的特點(diǎn),微基生物采用優(yōu)化的實(shí)驗(yàn)方法,更加準(zhǔn)確地分析口腔微生物的多樣性,及其與疾病、免疫系統(tǒng)的關(guān)系。
鼻咽微生物整體研究方案:
微基生物為您提供整體研究方案,分析鼻/咽微生物的群落結(jié)構(gòu)、多樣性等,研究鼻/咽中與健康、疾病等相關(guān)的微生物,及其與疾病的關(guān)系。
生殖道微生物整體研究方案:
微基生物提供從采樣到后續(xù)數(shù)據(jù)分析的整體研究方案,分析在不同時期(產(chǎn)前產(chǎn)后)、不同條件下(生殖道感染)生殖道微生物的變化,及其與宿主、嬰兒等健康的關(guān)系。

微基生物科技(上海)有限公司
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人體微生態(tài)(宏基因組)與健康的整體研究方案_微基生物,首發(fā)于微基生物。
]]>皮膚微生態(tài)多樣性,首發(fā)于微基生物。
]]>早期的皮膚微生物研究主要采用傳統(tǒng)的分離培養(yǎng)方法,來識別和描述微生物群落的組成和多樣性。傳統(tǒng)方法的局限性使研究者難以正確全面地闡明皮膚微生物的群落結(jié)構(gòu)和多樣性特點(diǎn)。高通量測序從根本上改變了人們對微生物群落的認(rèn)識,使人們得以系統(tǒng)地分析和認(rèn)識皮膚微生物的群落及其功能。
基于16S rRNA/18S rRNA/ITS基因,優(yōu)化實(shí)驗(yàn)方法,增加對痕量微生物的研究,利用二代測序技術(shù)(Roche 454、IlliminaMiSeq、Ion Torrent PGM)來分析皮膚微生物的多樣性,為進(jìn)一步理解皮膚的健康、疾病和感染等,全面了解皮膚微生物群落的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)及其與皮膚組織和環(huán)境的相互關(guān)系
微基生物進(jìn)行人體健康相關(guān)的研究與應(yīng)用:
微基生物提供與人體健康相關(guān)的生信/統(tǒng)計服務(wù):
(樣品群落結(jié)構(gòu)分析柱狀圖、多樣品對比樹圖、樣品群落結(jié)構(gòu)分析柱狀圖)
更多微生態(tài)方向研究和生物信息方面服務(wù),請?jiān)斣儯?em>400-660-9270
新鮮樣品:根據(jù)相關(guān)文獻(xiàn)收集樣品
DNA樣品:濃度大于10 ng/uL,總量大于500 ng的基因組DNA,DNA純度較差或降解會影響后繼的擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)。如果方便的話,可提供電子版DNA電泳檢測照片及 OD260/280的比值。
樣品運(yùn)送:送樣時采用干冰保存運(yùn)輸;若是距離較遠(yuǎn),建議采用干冰加冰袋,存放于冰盒中。


案例分析
標(biāo)題:人體皮膚微生物的多樣性概況
研究領(lǐng)域:皮膚微生物
分析物種:細(xì)菌
取樣方法:取皮膚表皮及皮下組織
高通量測序平臺:Illumina MiSeq 2×150
測序區(qū)域:16S rRNA gene V4區(qū)
主要結(jié)果:
?。?)無皮膚病史的五個樣本左、右手的113個OUT的系統(tǒng)發(fā)育樹結(jié)構(gòu)豐度

?。?)OUT單板描述

?。?).該圖展示了樣品根據(jù)它們Θ指數(shù)用UPGMA得到的發(fā)育樹

?。?).相對豐度比較

原文鏈接:http://genome.cshlp.org/content/18/7/1043.short
參考文獻(xiàn):
Grice, E. A., H. H. Kong, G. Renaud, A. C. Young, G. G. Bouffard, R. W. Blakesley, T. G. Wolfsberg, M. L. Turner and J. A. Segre (2008). “A diversity profile of the human skin microbiota.” Genome Research 18(7): 1043-1050.
皮膚微生態(tài)多樣性,首發(fā)于微基生物。
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