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      生信分析

      LDA EffectSize 組間群落差異分析

      Cladogram

      LEfSe定義是一種用于發(fā)現(xiàn)高維生物標(biāo)識(shí)和揭示基因組特征的軟件。LEfSe包括基因,代謝和分類,用于區(qū)別兩個(gè)或兩個(gè)以上生物條件(或者是類群)。該算法強(qiáng)調(diào)的是統(tǒng)計(jì)意義和生物相關(guān)性。讓研究人員能夠識(shí)別不同豐度的特征以及相關(guān)聯(lián)的類別

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      環(huán)形發(fā)育樹

      circlar-phylogenetic-tree01

      系統(tǒng)發(fā)生進(jìn)化樹(環(huán)形發(fā)育樹)在分子進(jìn)化研究中,系統(tǒng)發(fā)生的推斷能夠揭示出有關(guān)生物進(jìn)化過程的順序,了解生物進(jìn)化歷史和機(jī)制,可以通過序列間堿基的差異構(gòu)建進(jìn)化樹。選擇OTU的代表序列根據(jù)鄰位比對(duì)法(neighbor-joining)構(gòu)建進(jìn)化樹,結(jié)果可以用列圖或者圈圖的形式呈現(xiàn)。

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      微生物間相互關(guān)系分析圖

      1-interaction-between-microbes

      相關(guān)性分析定義是用于分析微生物間相互作用關(guān)系的經(jīng)典方法,相關(guān)性分析的作用可甄別出微生物群落間(包括細(xì)菌、真菌、古細(xì)菌等各類檢測(cè)目標(biāo))具有顯著相關(guān)性、強(qiáng)相關(guān)、正相關(guān)、負(fù)相關(guān)的各項(xiàng)

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      網(wǎng)絡(luò)圖

      01-interaction-network

      網(wǎng)絡(luò)圖怎么看?網(wǎng)絡(luò)圖有什么用?網(wǎng)絡(luò)圖的釋義?網(wǎng)絡(luò)圖可以形象的展示不同樣本或組之間物種的豐度情況,不同顏色代表不同樣本,中間的交叉節(jié)點(diǎn)代表不同的物種,節(jié)點(diǎn)的面積代表物種豐度。

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      客戶定制分析繪圖

      In-service

      微基生物還可根據(jù)客戶需要個(gè)性化和定制化自己的生信分析項(xiàng)目,如:在某篇論文上找到,但是在我公司對(duì)應(yīng)的分析列表中沒有,您可把論文發(fā)給微基,微基根據(jù)相互的后繼溝通給您個(gè)性的服務(wù)!

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      heatmap(熱圖)

      01heatmap

      Heatmap可以用顏色變化來反映二維矩陣或表格中的數(shù)據(jù)信息,它可以直觀地將數(shù)據(jù)值的大小以定義的顏色深淺表示出來。常根據(jù)需要將數(shù)據(jù)進(jìn)行物種或樣品間豐度相似性聚類,將聚類后數(shù)據(jù)表示在heatmap 圖上,可將高豐度和低豐度的物種分塊聚集。

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