查閱相關(guān)文獻,發(fā)現(xiàn)在獺兔腸道菌群相關(guān)的文獻中,獺兔的樣本主要分為兩種,一種是腸道內(nèi)容物,一種是糞便,其中大多數(shù)文章采用的是腸道內(nèi)容物。
1 腸道內(nèi)容物的采集方法
將獺兔解剖后,將腸道內(nèi)容物取出,可以采集盲腸,也可以采集其他部位。 需要注意的是,不同部位的腸道菌群不同,同一批樣本,建議采集同一腸道部位的內(nèi)容物。由于不同個體間,腸道菌群存在差異,建議 1 只獺兔的腸道內(nèi)容物為1 個樣本,不要將多只獺兔的樣本混為 1 個。
在采樣之前,先準備好無菌管。如果腸道內(nèi)容物為固體,可以將固體內(nèi)容物, 采集下來,放到無菌管中。若腸道內(nèi)容物固體物較少,粘液較多,可以用無菌的 PBS 將粘液和少量固體物沖洗下來,放到無菌管中。固體樣本,建議采集 1g,最少需要 0.1-0.2g。液體樣本,建議采集 15-20ml。樣本采集好后,盡快放到-20 或-80 冰箱。在樣本運輸時,請用干冰+泡沫盒進行快遞。干冰一天揮發(fā)約 3kg,快遞運輸時間*3Kg,即為所需的干冰量。
2 糞便的采集方法
與其他兔子一樣,獺兔的糞便也分別硬便和軟便。硬便一般是白天排出,軟便一般是晚上排出。需要注意的是,軟便排出后,獺兔會將軟便給吃掉。許多文獻已表明,硬便和軟便的菌群結(jié)構(gòu)差異比較大,建議同一只獺兔,分別收集其硬便和軟便,作為 2 個不同的樣本。
在采樣之前,先準備好無菌管、鑷子和酒精棉,建議采集新鮮的糞便。在籠子或準備采集糞便的地方,提前鋪上無菌紙,用酒精棉擦拭鑷子。獺兔排出硬便后,盡快將新鮮的硬便用鑷子夾到無菌管中。如果采集其他獺兔,則將鑷子用酒精棉擦拭、滅菌后,再采集。
軟便的采集方法,可以參照硬便的采集方法。如果擔(dān)心獺兔吃掉軟便,可以給獺兔帶個脖套。
建議 1 個樣本采集 1g,最少需要 0.1-0.2g。樣本采集好后,盡快放到-20 或-80 冰箱。在樣本運輸時,請用干冰+泡沫盒進行快遞。干冰一天揮發(fā)約 3kg,快 遞運輸時間*3Kg,即為所需的干冰量。
假設(shè)沒有低溫保存運輸措施,可以采用微基生物研發(fā)的常溫采集保存液,可以在室溫下保存 14 天。

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