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      OTU群落聚類及相關(guān)分析

        OTU(Operational Taxonomic Units)是在系統(tǒng)發(fā)生學(xué)研究或群體遺傳學(xué)研究中,為了便于進(jìn)行分析,人為給某一個分類單元(品系,種,屬,分組等)設(shè)置的同一標(biāo)志。在生物信息分析中,一般來說,測序得到的每一條序列來自一個菌。要了解一個樣品測序結(jié)果中的菌種、菌屬等數(shù)目信息,就需要對序列進(jìn)行歸類操作(cluster)。通過歸類操作,將序列按照彼此的相似性分歸為許多小組,一個小組就是一個OTU。根據(jù)客戶指定的相似度(96%、97%或者98%),對所有序列進(jìn)行OTU 劃分并進(jìn)行生物信息統(tǒng)計(jì)分析。通常在97%的相似水平下的OTU 進(jìn)行生物信息統(tǒng)計(jì)分析。

      OTU-cluster-analysis

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