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      首頁 > 用于微生物多樣性的統(tǒng)計(jì)方法 > 稀釋性曲線(rarefaction curve)

      稀釋性曲線(rarefaction curve)

        稀釋性曲線(rarefaction curve):一般是從樣本中隨機(jī)抽取一定數(shù)量的個體,統(tǒng)計(jì)出這些個體所代表物種數(shù)目,并以個體數(shù)與物種數(shù)來構(gòu)建曲線。它可以用來比較測序數(shù)量不同的樣本物種的豐富度,也可以用來說明樣本的取樣大小是否合理。分析采用對優(yōu)化序列進(jìn)行隨機(jī)抽樣的方法,以抽到的序列數(shù)與它們所能代表OTU的數(shù)目構(gòu)建rarefaction curve。稀釋性曲線圖中,當(dāng)曲線趨向平坦時,說明取樣的數(shù)量合理,更多的取樣只會產(chǎn)生少量新的OTU,反之則表明繼續(xù)取樣還可能產(chǎn)生較多新的OTU。因此,通過作稀釋性曲線,可以得出樣品的取樣深度情況。

      稀釋性曲線分析結(jié)果

      默認(rèn)是在 97%相似性水平下劃分OUT并制作各樣品的稀疏曲線。

      huanjing 9

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