RDA分析(Redundancy analysis)

RDA分析(Redundancy analysis)

RDA分析，即冗余分析，對(duì)比主成分分析可以發(fā)現(xiàn)，其實(shí)冗余分析就是約束化的主成分分析。PCA和RDA的目的都是尋找新的變量來(lái)代替原來(lái)變量，它們主要區(qū)別在于后者樣方在排序圖中的坐標(biāo)是環(huán)境因子的線性組合。它的優(yōu)點(diǎn)就是考慮了環(huán)境因子對(duì)樣方的影響，因?yàn)橛行r(shí)候我們想得到在某些特定條件限制下（如海拔高度，PH值，酸堿度，疾病組與健康組等）物種的分布?？梢缘玫侥男┪锓N受特定的環(huán)境因子影響。可以得到如某些植被是受海拔高度影響，某些菌受PH值或酸堿度的影響等。

 

對(duì)數(shù)據(jù)的準(zhǔn)備，需要兩個(gè)矩陣，一個(gè)數(shù)據(jù)矩陣，一個(gè)環(huán)境矩陣，數(shù)據(jù)矩陣和pca準(zhǔn)備數(shù)據(jù)相同，環(huán)境矩陣形式如下，如果有不能量化的環(huán)境因子（如性別，疾病與健康等）聯(lián)系我們，來(lái)量化您的數(shù)據(jù)。

對(duì)數(shù)據(jù)的要求，樣方的個(gè)數(shù)必須大于環(huán)境因子的個(gè)數(shù)。

	環(huán)境因子1	環(huán)境因子2
樣方1
樣方2