venn 圖可用于統(tǒng)計(jì)多個(gè)樣品中所共有和獨(dú)有的OTU 數(shù)目,可以比較直觀的表現(xiàn)環(huán)境樣品的OTU 數(shù)目組成相似性及重疊情況。通常情況下,分析時(shí)選用相似水平為97%的OTU 樣品表。
軟件:使用97%相似度的OTU,R 語言工具統(tǒng)計(jì)和作圖。
參考文獻(xiàn):
Fouts DE, Szpakowski S, Purushe J, Torralba M, Waterman RC, et al. (2012) Next Generation
Sequencing to Define Prokaryotic and Fungal Diversity in the Bovine Rumen. PLoS ONE 7(11): e48289. doi:10.1371/journal.pone.0048289.
例圖:


注:不同的顏色代表不同的樣本,如果兩個(gè)不同顏色圓圈重疊的區(qū)域標(biāo)注有數(shù)字100,說明這兩個(gè)樣品均有序列被劃分入相同的OTU 中,且這樣的OTU 有100 個(gè)。圖中的樣品數(shù)量一般為2~5 個(gè)。

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